11

Re: Пикотехнология белков, ДНК, РНК - 2

Victoria пишет:

Страница CASP10:
http://predictioncenter.org/casp10/index.cgi

Кушелев: А Вы можете закачать на конкурс два варианта моделей?

12

Re: Пикотехнология белков, ДНК, РНК - 2

Victoria пишет:

Новые задачи конкурса:

>T0660 HR3534I, , 108 residues
MYRALYAFRSAEPNALAFAAGETFLVLERSSAHWWLAARARSGETGYVPPAYLRRLQGLE
QDVLQAIDRAIEAVHNTAMRDGGKYSLEQRGVLQKLIHHRKETLSRRG

>T0661 PpR99, , 215 residues
MISILRRGLLVLLAAFPLLALAVQTPHEVVQSTTNELLGDLKANKEQYKSNPNAFYDSLN
RILGPVVDADGISRSIMTVKYSRKATPEQMQRFQENFKRSLMQFYGNALLEYNNQGITVD
PAKADDGKRASVGMKVTGNNGAVYPVQYTLENIGGEWKVRNVIVNGINIGKLFRDQFADA
MQRNGNDLDKTIDGWAGEVAKAKQAADNSPEKSVK

>T0662 PaT415, , 79 residues
MPNDMEDHLLTVLSVASGVPKEEISRDSRMEDLAFDSLVVSELSLKLRKEFGVTGVDDEL
DLLETVDELFQLVEKHRAA

Организаторы так и не согласились давать нуклеотидные последовательности?

13

Re: Пикотехнология белков, ДНК, РНК - 2

Kushelev пишет:
Victoria пишет:

А.Ю., тема ПИКОТЕХНОЛОГИЯ (200 стр) весит 555 МБ. Как Вы хотите их получить?

Вы можете заархивировать её в виде одного файла и закачать на яндекс?

Напишите куда (ссылку)

14

Re: Пикотехнология белков, ДНК, РНК - 2

Кушелев: Я правильно понял, что в настоящее время Вы отправляете на конкурс только один вариант, в котором расстояния между атомами азота и углерода скачет в несколько раз?

15

Re: Пикотехнология белков, ДНК, РНК - 2

Kushelev пишет:
Victoria пишет:

Страница CASP10:
http://predictioncenter.org/casp10/index.cgi

Кушелев: А Вы можете закачать на конкурс два варианта моделей?

А.Ю., а почему Вы хотите чтобы я закачивала два варианта и не регистрируетесь сами.
Мне придётся отдуваться за двоих, а это время.

16

Re: Пикотехнология белков, ДНК, РНК - 2

Victoria пишет:
Kushelev пишет:
Victoria пишет:

А.Ю., тема ПИКОТЕХНОЛОГИЯ (200 стр) весит 555 МБ. Как Вы хотите их получить?

Вы можете заархивировать её в виде одного файла и закачать на яндекс?

Напишите куда (ссылку)

http://narod.yandex.ru/

"Загрузить файлы"

17

Re: Пикотехнология белков, ДНК, РНК - 2

Victoria пишет:
Kushelev пишет:
Victoria пишет:

Страница CASP10:
http://predictioncenter.org/casp10/index.cgi

Кушелев: А Вы можете закачать на конкурс два варианта моделей?

А.Ю., а почему Вы хотите чтобы я закачивала два варианта и не регистрируетесь сами.
Мне придётся отдуваться за двоих, а это время.

У Вас есть выбор: либо работать в команде и "отдуваться", либо работать в одиночку без шансов на успех, хотя их и так "ноль целых, ноль десятых", а если на конкурс отсылать только некорректные файлы, где длина связи N-C то полтора ангстрема, то половина ангстрема, то шансов на успех не только "ноль десятых", но и ноль миллионных smile

http://img-fotki.yandex.ru/get/6305/126580004.50/0_bc6ea_b044f9d0_orig.gif

18

Re: Пикотехнология белков, ДНК, РНК - 2

У Вас тоже есть выбор: либо самостоятельно зарегистрироваться и загружать свои файлы белков на конкурс, либо уговаривать это делать за Вас таких нянек как я при этом обругивая мои модели.
Насчет длины связи С-N, то в моих моделях она абсолютно одинакова. Вы приняли наползание двух атомов РАЗНЫХ аминокислот за маленькую длину связи в одной аминокислоте.
Опять же я всегда говорила, что моя программа декодирует только структурный шаблон, который должен свернуться в нативную конформацию в зависимости от микроокружения.

А.Ю., я бы и дальше загружала Ваши модели вместо Вас, если бы Вы не стали настаивать, что мои модели никуда не годятся и я пользуюсь Вашими.

19

Re: Пикотехнология белков, ДНК, РНК - 2

Kushelev пишет:

http://narod.yandex.ru/

"Загрузить файлы"

Загрузила сюда: http://narod.ru/disk/48731455001.866793 … 0.rar.html

20

Re: Пикотехнология белков, ДНК, РНК - 2

Victoria пишет:

У Вас тоже есть выбор: либо самостоятельно зарегистрироваться и загружать свои файлы белков на конкурс, либо уговаривать это делать за Вас таких нянек как я при этом обругивая мои модели.

Кушелев: Почему "нянек"? Речь идёт о команде. Если каждый будет "сам за себя", то "один в поле не воин" smile

Только объединение в команду может дать шансы на успех, в частности, в различных конкурсах. И раньше Вы это вроде бы понимали...

Что касается "обругивать", то у меня и в мыслях этого не было. Я просто обнаружил, что в Ваших моделях длина связи N-C меняется в несколько раз. А это означает, что модель некорректна на элементарном уровне. Я бы не рискнул с такой моделю выходить не только на конкурс...