251

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 37

Уважаемая Виктория!

Мне хотелось бы всё-таки услышать Ваш ответ по поводу 310-спирали гонадотропина. Я хочу понять, каким образом Вы без композиционных кодов 4 сможете получить модель 310-спирали?

http://nanoworld88.narod.ru/data/209.files/0_48027_3b50efe_orig.gif
Программа Prosolver по Вашему алгоритму не показывает никакой спирали...

Как впрочем и для пи-спирали:

http://nanoworld88.narod.ru/data/288_files/0_85d09_8d7f6a3d_orig.gif

252

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 37

Анатолий Шестопалов пишет:
Kushelev пишет:

Нужно заменть  NO2-  органического происхождения на NO2- неорганического происхождения.

Чем могут отличаться одни и теже химические элементы или их соединения, так называемых неорганического и органического происхождения? Насколько мне известно СН4 органического и неорганического происхождения ничем не отличаются.

А аминокислоты органического происхождения все L-форм...

Прямая цепь ДНК отличается от обратной магнитными свойствами. Это позволяет белкам отличать прямую цепь от обратной. А молекулярные биологи до моего открытия ломали голову. Многие и сейчас продолжают ломать... smile

Но в случае М-Динитробензола дело оказалось в геометрических пропорциях smile

http://img-fotki.yandex.ru/get/6303/126580004.56/0_bd350_7c8a62a5_S.gif
В соседних позициях группы -NO2 просто не умещаются smile

С группами -OH другая, но тоже геометрическая хитрость. В ближайшее время покажу модель...

253

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 37

T0664

FT   CDS             1..1620
     ATGAAGAAAA ATACAATAAT ACAGTTTATA GCCACTGGTA TGTTTCTTTT CGGTGCAACT
     GCATGTACAG GAAACTTTGA AGATTACAAT AAAAATCCTC ATGAACCAGA CCAAAATGAC
     ATGGGAGTAG ATTGGTATTT GGTAAGATCA TTAGCTCTTA ATTTACAAGA TTTGATGATG
     CCAGAACAAG AGAACTTTTC TCAATATGTA GACTGTTTGA TGGCAGGAGC ATTTTCGGGA
     TATGTAGCAG ACTCCAATTT GGGTACAGGC TGGTCTGGTC GTTACGCAAC TTATAATCCT
     TCAGACGATT GGAAAAAAAT TCCATTCAAT GATTTTTATT CAAAGTTTTA TCCTGATTAC
     TTCAATTTGA AAAATCAAAG CGATGATGAA CTTTTCTTAT CGTTGGCCGA GTTATATCGT
     ATCGTCGTAA TGTTACGTGT AACAGATACA TATGGTCCCA TCCCTTATTC AAAAGTAGGT
     GCAGCTAATG CGATCAAATC CCCTTATGAT TCTCAGCAAG CTGTCTATGC CAAAATGCTA
     GAAGATTTGG ATAATATTAT TACAGTATTA GGAAAGTTTG GCAACCAAAG CTTCAGCTCA
     AGTGCTGATA GAATTTATAA TGGCAATACA TCAGCATGGT ATAAGTTTGC CAACTCTTTG
     AAGCTAAGAA TGGCGATGCG TACTTGCTAT GTAGCAGGAT TTAACGTGAA TGGAAAAACA
     TCACAGCAAT TGGCTGAAGA AGCTGTAGCA GCAGGTGTTA TGACTGCTGC AACTGATGGC
     GCTTATCGTA AAGTTGCCGA TCATAATCCA TGGCAACGTT TTATGGTACT ATGGTCAGAT
     GCACGAATTT CAGCGGATTT AACCTGCTAC ATGAATGCAT ACAACGATCC TCGTCGCGAA
     GCATATTATG ATAAAAGTAC TTTTGGCACC GTGTCGGGAA ATGCATATAC TGGAGAAGAA
     AGTTATGTAG GTTTACGTCG GGGTATTCTG CAAGGACAAT ATAACTCCTG GTCACAAGGC
     TCTTCTTGTA TGAAAGTCAC TACGAGTGAT AATATAGTTG TGTTCCGTGC ATCAGAAGTC
     GCTTTCTTGC GTGCTGAAGG AGCTCTTCGT AACTGGAACA TGGGAGGAAC AGCTAAAGAC
     TTCTATGAGG AAGGAATCCG TTTGTCGTTT GAAGAAAACG GAATTACCAG TGGAGTCGAA
     AATTATCTTG CAAGTACGGG AAAAGTAGAA GCATATAAAG ATCCACTGAA AGGACAAAGT
     GCCCAAACTT ATGATTACTC TGGAGCTATT AATACAAATG TAACTGTGGC ATGGTCTGGA
     GGTGATTTTG AAAAAAGCTT AGAACAGATT ATTACTCAAA AATGGATTGC AAACTTTCCA
     AATGGTATGG AATCATGGAC TGAGTACCGT CGTACAGGCT ATCCTAAATT AATGCCAATG
     GCAGCAAATG CAAGTGGAGG AATTGTTAAT GATGCGGAAG GTGCACGACG CATGCCATAT
     CCAACTGATG AATATCGTGA AAATAGAGAA AGCGTAGAAG CAGCAGTTGC GACATTGACA
     CAAGAGTCCA AGACTAAAAG AGGAGATACG ATGGCAACTC ACGTATGGTG GGACTGTAAA
//

Композиционный код:

1,1,3,3,2,2,2,1,3,2,1,3,3,1,3,3,1,3,2,3,2,3,2,2,1,3,3,3,1,
3,3,3,3,3,3,2,1,3,3,1,1,2,2,3,1,3,1,2,3,2,3,3,3,3,3,3,3,1,
1,1,2,3,3,1,1,3,3,3,3,2,1,3,1,1,2,2,2,3,4,2,3,2,2,1,1,3,1,
3,2,1,1,3,3,3,1,2,3,3,3,3,2,1,3,1,3,3,3,2,1,3,3,3,3,2,1,3,
3,3,3,1,1,3,1,3,3,3,1,3,3,3,3,1,3,4,1,1,1,3,3,3,1,1,2,1,3,
3,2,2,3,2,3,3,1,1,3,3,2,3,2,3,2,3,3,4,1,3,1,3,3,3,3,1,3,3,
1,3,1,3,1,2,3,3,1,3,3,3,3,2,2,3,2,1,3,1,1,3,1,1,1,2,3,3,3,
3,3,3,3,1,3,2,2,2,1,3,1,3,1,1,3,1,1,2,3,1,4,1,3,3,1,3,2,2,
2,3,1,4,3,2,3,2,2,1,3,1,3,3,3,3,2,2,2,3,3,1,3,3,2,3,3,1,3,
3,3,3,3,1,3,3,3,2,1,3,3,3,1,2,2,1,2,3,2,2,3,2,4,3,3,1,1,1,
1,3,2,1,1,3,3,3,1,3,2,3,3,3,3,3,3,3,1,1,4,4,2,3,2,3,3,2,3,
3,3,3,2,3,3,3,4,3,3,4,3,2,3,3,1,1,1,2,3,1,3,3,3,1,3,1,3,4,
3,3,3,2,3,4,1,3,2,2,3,1,3,1,1,3,3,3,2,3,3,3,1,1,1,1,2,2,2,
3,3,1,1,3,1,3,2,1,3,1,4,3,3,3,1,2,3,1,3,2,1,3,3,3,3,2,3,4,
2,3,2,3,2,3,3,3,2,4,3,2,3,3,1,3,3,3,3,1,3,2,3,3,3,2,3,2,3,
4,2,1,3,2,3,3,3,3,3,1,3,3,1,3,3,3,3,3,1,3,2,1,3,2,3,3,1,3,
2,1,3,1,1,3,3,2,1,3,3,3,3,1,2,1,2,2,3,2,3,2,2,3,3,3,3,4,3,
3,2,2,1,1,2,3,2,3,3,3,3,3,3,3,3,3,1,2,3,2,2,3,4,2,1,2,3,1,
1,1,3,3,3,2,3,4,1,2,3,1,2,1,1,1,3,3

http://img-fotki.yandex.ru/get/6210/126580004.56/0_bd384_6561e56e_orig.gif

254

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 37

T0665

FT   CDS             1..201
     AAAAATGTTA TTAAAAAGAA GGGAGAAATT ATCATTTTAT GGACAAGAAA TGATGACCGG
     GAAATTTTAT TGGAGTGTCA GAAAAGAGGG CCATCATTTA AAACATTTGC ATATTTAGCT
     GCCAAGTTGG ATAAAAATCC AAATCAGGTC TCAGAAAGAT TCCAGCAGCT AATGAAGCTC
     TTTGAAAAGT CAAAATGCAG A
//

Композиционный код:

3,3,3,3,3,1,1,2,3,3,1,3,3,1,2,3,3,3,1,4,3,3,3,1,1,3,1,3,3,4,
2,2,3,3,2,3,2,3,3,3,1,1,1,3,3,3,2,3,1,1,2,3,3,1,1,1,2,1,1,1,
3,3,1,2,3,1,3

http://img-fotki.yandex.ru/get/6302/126580004.56/0_bd385_e8e96a33_orig.gif

http://img-fotki.yandex.ru/get/6305/126580004.56/0_bd386_88104633_L.png
Оригинал: http://img-fotki.yandex.ru/get/6305/126 … 3_orig.png

255

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 37

Kushelev пишет:

http://img-fotki.yandex.ru/get/6303/126580004.56/0_bd350_7c8a62a5_S.gif
Оригинал: http://img-fotki.yandex.ru/get/6303/126 … 5_orig.gif
М-динитробензол. Понятно, почему -NO2 не может замещать соседние атомы водорода?

Может. smile
Существует ведь вполне устойчивый о-динитробензол.
Правда, его получают, разумеется, не прямым нитрованием нитробензола. smile

256

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 37

В о-динитробензоле зелёные уши-чебурашки должны быть ориентированы в плоскости перпендикулярной плоскости бензольного цикла (в отличие от м-динитробензола). Это возможно при взаимодействии сиреневых электронов-колец атома азота сразу с двумя красными-электронами-кольцами соответствующего атома углерода.
Я хочу сказать, что в о-динитробензоле связь С-N будет иметь характер двойной связи: С=N, в отличие от одинарной в м-динитробензоле. Это можно установить экспериментально по меньшей длине и большей энергии данной связи (между углеродом и азотом) в о-динитробензоле, по сравнению с м-динитробензолом.

257

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 37

Victoria пишет:

В о-динитробензоле зелёные уши-чебурашки должны быть ориентированы в плоскости перпендикулярной плоскости бензольного цикла (в отличие от м-динитробензола).

Да, но в рисунке Кушелева такое невозможно. smile

А вообще я хочу, чтобы АЮ пересмотрел свои статические молекулы на предмет динамики взвимодействия, механизмов реакций и пр., например - нарисовал в мультиках реакции с традиционным объяснением ориентаций заместителей 1-го и 2-го рода через индуктивный эффект и гиперконъюгацию. Да и вообще - коснулся темы реакций - что и как происходит с электронами в процессе (а то физики говорят о квантовых скачкАх, химики рисуют промежуточные неустойчивые псевдо-соединения, а как оно там на самом деле - ?...)

258

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 37

Игорь пишет:
Kushelev пишет:

http://img-fotki.yandex.ru/get/6303/126580004.56/0_bd350_7c8a62a5_S.gif
Оригинал: http://img-fotki.yandex.ru/get/6303/126 … 5_orig.gif
М-динитробензол. Понятно, почему -NO2 не может замещать соседние атомы водорода?

Может. smile
Существует ведь вполне устойчивый о-динитробензол.
Правда, его получают, разумеется, не прямым нитрованием нитробензола. smile

Любопытно. Надо посмотреть, может ли группа -NO2 отклониться от симметричного положения до такой степени, чтобы получилась модель o-динитробензола? Кстати, а существует ли соединение с замещением во всех 6-ти позициях?

259

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 37

http://nanoworld.org.ru/post/15930/#p15930

Victoria пишет:

В о-динитробензоле зелёные уши-чебурашки должны быть ориентированы в плоскости перпендикулярной плоскости бензольного цикла (в отличие от м-динитробензола). Это возможно при взаимодействии сиреневых электронов-колец атома азота сразу с двумя красными-электронами-кольцами соответствующего атома углерода.
Я хочу сказать, что в о-динитробензоле связь С-N будет иметь характер двойной связи: С=N, в отличие от одинарной в м-динитробензоле. Это можно установить экспериментально по меньшей длине и большей энергии данной связи (между углеродом и азотом) в о-динитробензоле, по сравнению с м-динитробензолом.

http://img-fotki.yandex.ru/get/6306/126580004.56/0_bd397_f7af305a_S.gif
Оригинал: http://img-fotki.yandex.ru/get/6306/126 … a_orig.gif

Кушелев: Вы хотите сказать, что возможно такое соединение атома углерода с атомом азота?

Скрипт для 3DS Max:


m = torus radius1:7.6 radius2:1 segs:100 sides:12 position:[0,0,0] wirecolor:[0,0,255]
m1 = copy m wirecolor:[255,0,0]
m2 = copy m wirecolor:[255,0,0]
move m1 [0 , 0, 8]
move m2 [0 , 0, -8]
rotate m 90 [1,0,0]
move m [0 , 8, 0]
m11 = torus radius1:5.5 radius2:0.75 segs:100 sides:12 position:[0,0,5.5] wirecolor:[255,0,0]
m21 = torus radius1:5.5 radius2:0.75 segs:100 sides:12 position:[0,0,-5.5] wirecolor:[255,0,0]
m12 = torus radius1:4 radius2:0.5 segs:100 sides:12 position:[0,0,3.5] wirecolor:[255,0,0]
m22 = torus radius1:4 radius2:0.5 segs:100 sides:12 position:[0,0,-3.5] wirecolor:[255,0,0]
s = sphere radius:1 segs:20 position:[0,0,0] wirecolor:[255,255,0]
s1 = sphere radius:0.5 segs:20 position:[0,12,0] wirecolor:[255,255,0]
g1 = group #(m,m1,m2,m11,m21,m12,m22,s,s1)
move g1 [0,16,0]
g1.pivot = [0,0,0]
ungroup g1
nm = copy m wirecolor:[0,0,255]
nm1 = copy m1 wirecolor:[255,0,255]
nm2 = copy m2 wirecolor:[255,0,255]
nm11 = copy m11 wirecolor:[255,0,255]
nm21 = copy m21 wirecolor:[255,0,255]
nm12 = copy m12 wirecolor:[255,0,255]
nm22 = copy m22 wirecolor:[255,0,255]
ns = copy s wirecolor:[255,255,0]
ns1 = copy s1 wirecolor:[255,255,0]
g2 = group #(nm,nm1,nm2,nm11,nm21,nm12,nm22,ns,ns1)
g2.pivot = [0,16,0]
rotate g2 180 [0,0,1]
rotate g2 90 [0,1,0]
move g2 [0 , -10, 0]
g1 = group #(m,m1,m2,m11,m21,m12,m22,s,s1)
g4 = group #(g1,g2)
g4.rotation.controller[2].controller.value = 0
animate on
at time 100 g4.rotation.controller[2].controller.value = 180

260

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 37

Игорь пишет:
Victoria пишет:

В о-динитробензоле зелёные уши-чебурашки должны быть ориентированы в плоскости перпендикулярной плоскости бензольного цикла (в отличие от м-динитробензола).

Да, но в рисунке Кушелева такое невозможно. smile

А вообще я хочу, чтобы АЮ пересмотрел свои статические молекулы на предмет динамики взвимодействия, механизмов реакций и пр., например - нарисовал в мультиках реакции с традиционным объяснением ориентаций заместителей 1-го и 2-го рода через индуктивный эффект и гиперконъюгацию. Да и вообще - коснулся темы реакций - что и как происходит с электронами в процессе (а то физики говорят о квантовых скачкАх, химики рисуют промежуточные неустойчивые псевдо-соединения, а как оно там на самом деле - ?...)

Кушелев: Давайте для начала со статикой разберёмся. smile