661

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 36

Вышел 295-ый выпуск рассылки "Новости лаборатории Наномир":

http://nanoworld88.narod.ru/data/295.htm

Дайджест:

Доклад Александра Кушелева в Доме предпринимателей 2012-04-19
Александр Никонов: "Наука подбирается к тайне бессмертия"
Радиус электрона в корень квадратный из 3 меньше радиуса 8-электронной оболочки.
Protein is coded in genom and synthesized in ribosome as a structural template from peptide bound rotamers of sequence
Патент школьного учителя из Германии 1951г.
KARL SCHWAIGER,  Atomic Structure
Кеннету Снельсону 85!
Патент Кеннета Снельсона (1964г.)
Кушелев Снельсону
Чтобы самолёты не падали...
Вести c ускорителей и не только!
Пикотехнология белков, ДНК, РНК

http://img-fotki.yandex.ru/get/6207/126580004.4d/0_ba7ff_3916c2c5_M.jpg
http://img-fotki.yandex.ru/get/6107/31556098.b3/0_6bf56_1c8d512f_M.jpg
http://img-fotki.yandex.ru/get/6108/126580004.4d/0_bacba_a9e3afa5_M.jpg
http://img-fotki.yandex.ru/get/6109/126580004.4d/0_bacbb_11631373_M.gif
http://img-fotki.yandex.ru/get/3613/nanoworld.10e/0_2e4c3_78cf3dfc_M.png
http://img-fotki.yandex.ru/get/6208/126580004.4d/0_ba8d1_26dc55c9_M.png
http://img-fotki.yandex.ru/get/6108/126580004.4d/0_ba85c_13d69be0_M.png
http://img-fotki.yandex.ru/get/6207/126580004.4d/0_ba85b_16f17507_M.jpg
http://img-fotki.yandex.ru/get/5114/126580004.4d/0_ba8b3_a63c4079_M.jpg
http://img-fotki.yandex.ru/get/6109/126580004.4d/0_ba8c1_76f6696a_S.gif

662

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 36

А.Ю., а Вы читали статью И. А. Болдова "Геометрическая теория строения элементарных частиц": http://www.trinitas.ru/rus/doc/0016/001b/00160203.htm.
Правда у него электрон уже сразу октаэдр, а не кольцо, из которых можно сложить любой из 5-ти правильных многогранников, в том числе и октаэдр.

663

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 36

Victoria пишет:

А.Ю., а Вы читали статью И. А. Болдова "Геометрическая теория строения элементарных частиц": http://www.trinitas.ru/rus/doc/0016/001b/00160203.htm.
Правда у него электрон уже сразу октаэдр, а не кольцо, из которых можно сложить любой из 5-ти правильных многогранников, в том числе и октаэдр.

Кушелев: Благодарю за ссылку. Прочитал. Жаль, что в геометрических моделях автора не просматривается физический смысл...

664

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 36

А Вы ему напишите и растолкуйте этот самый физический смысл: http://www.trinitas.ru/rus/doc/avtr/01/0506-00.htm

665

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 36

Victoria пишет:

А Вы ему напишите и растолкуйте этот самый физический смысл: http://www.trinitas.ru/rus/doc/avtr/01/0506-00.htm

У меня есть другое предложение. Вы приглашаете его на форум лаборатории Наномир, и мы его спросим, каков физический смысл его моделей?

666

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 36

Пикотехнология белков, ДНК, РНК

Victoria пишет:

Это существенно завышенное значение. Для водорода:
а) значение Боровского радиуса (h2/mke2 = 0.529 177 208 59) для нижней орбиты электрона этого атома водорода по теории Бора
б) простейшее решение уравнения Шредингера (= 0.53)

Кушелев: Уравнение Шредингера не имеет физического смысла, т.к. описывает плотность вероятности точечного электрона, а он не точечный, а задаёт своим размером размер атома водорода smile Более того, электрон - многокомпонентный процесс, а уравнение Шредингера написано для одной составляющей, причём решение имеет сферическую симметрию, т.е. к тороидальной форме электрона не имеет отношения smile

Так что забудьте всё, чему Вас учили по неправильным моделям электрона. smile

Victoria пишет:

б) простейшее решение уравнения Шредингера (= 0.53)
в) по формуле Соколик на основе зависимости между ковалентным и атомным радиусом:
    атомный R (для водорода радиус электрона) = 1.732 умножить на ковалентный r атома водорода = 0.55424,
где 1.732 -- это коэффициент, который есть соотношение радиусов полувписанной и вписанной сфер в тетраэдр. 
Величина, которую я рассчитала с помощью аппроксимации атомов телами Платона,  практически совпадает с двумя предыдущими. Отклонение на две сотых скорее всего связано с тем, что кольцо-электрон атома водорода располагается не совсем экваториально (поэтому его радиус должен быть чуть-чуть меньше атомного радиуса), а плоскость его вращение совпадает с плоскостями граней тетраэдра, центр которого совпадает с протоном атома водорода.
Обратите внимание, что у Вас существенно (в 1.5 раза) большее значение радиуса электрона.

Кушелев: Какие проблемы? Делайте модели с меньшим радиусом кольца-электрона. Правда, программы PyMOL, RasTop и др. будут показывать связи между атомами в Ваших моделях некорректно, т.к. в этих браузерах заложены экспериментальные межатомные расстояния, а Ваши получаются раза в полтора меньше...

Victoria пишет:

Кстати для других атомов радиус их электронов будет иным, не исключено что и таким, как Вы посчитали. Но унифицировать рассчитанный радиус электрона для атомов одного элемента на все остальные -- грубейшая ошибка. А Вы посчитали для кислорода (или хлора), а моделируете углероды и азоты.

Кушелев: Конечно радиусы электронов в разных атомах разные, но на внешних оболочках ионов углерода, азота, кислорода (именно из них состоит глицин) они почти одинаковые, т.е. различием радиусов в данном случае можно пренебречь.

Если у Вас появится кольцегранная модель бензола, будет очень интересно на неё посмотреть smile

http://nanoworld88.narod.ru/data/025.files/sld002.jpeg

667

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 36

Victoria пишет:

Вот дотяну до майских праздников и появится smile.
Стесняюсь спросить, а инвесторы так молчаливо отказали в регистрационном взносе на Лас Веговскую конференцию или они об этой нужде не в курсе?

Кушелев: Вероятно, просто денег нет smile

668

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 36

Victoria пишет:
Kushelev пишет:
Victoria пишет:

б) простейшее решение уравнения Шредингера (= 0.53)
в) по формуле Соколик на основе зависимости между ковалентным и атомным радиусом:
    атомный R (для водорода радиус электрона) = 1.732 умножить на ковалентный r атома водорода = 0.55424,
где 1.732 -- это коэффициент, который есть соотношение радиусов полувписанной и вписанной сфер в тетраэдр. 
Величина, которую я рассчитала с помощью аппроксимации атомов телами Платона,  практически совпадает с двумя предыдущими. Отклонение на две сотых скорее всего связано с тем, что кольцо-электрон атома водорода располагается не совсем экваториально (поэтому его радиус должен быть чуть-чуть меньше атомного радиуса), а плоскость его вращение совпадает с плоскостями граней тетраэдра, центр которого совпадает с протоном атома водорода.
Обратите внимание, что у Вас существенно (в 1.5 раза) большее значение радиуса электрона.

Кушелев: Какие проблемы? Делайте модели с меньшим радиусом кольца-электрона. Правда, программы PyMOL, RasTop и др. будут показывать связи между атомами в Ваших моделях некорректно, т.к. в этих браузерах заложены экспериментальные межатомные расстояния, а Ваши получаются раза в полтора меньше...

Так ковалентный радиус атома (расстояние между центрами атомов в молекуле) -- это тоже экспериментальные данные, которые по Вашим словам должны быть заложены во вьюера.

Кушелев: Совершенно верно!

Давайте посмотрим, какая длина "стандартной связи" в органической молекуле.

http://www.bse.info-spravka.ru/bse/id_51046

C-C...... 1,54 A
C=C........ 1,34 A
C-Cl...... 1,77 A
C- - -C (в бензоле)... 1,39

Кушелев: В бензоле расстояние между центрами атомов равно двум радиусам внешних электронов. Откуда радиус электрона равен 1.39/2=0.695 A
По Голдшмидту радиус электрона получается 1.32/1.732=0.762
Отличие составляет 8.8%
Неплохо для экспериментов начала 20-го века, правда? И ещё не факт, что Голдшмидт ошибся больше, чем те, кто рассчитывал межатомное расстояние в бензоле. Ведь это именно расчёт, а не экспериментальное значение межатомного расстояния smile

http://img-fotki.yandex.ru/get/6209/126580004.4d/0_bacc1_b248f261_L.jpg
Оригинал: http://img-fotki.yandex.ru/get/6209/126 … 1_orig.jpg

По Гольдшмидту (с учётом кольцегранных моделей) длина одинарной связи HO-OH получается 2.155A (0.2155 нм)

Стандартные длины связей в молекулах (нм):

Н2 ... 0.074
F2 ... 0.142
Cl2 ... 0.200
Br2 ... 0.228
O-O ... 0.148           (H2O2)

Различие для молекулы Cl2 составляет ((2.155-2)/2.155)*100=7.2%
Для молекулы O2 длина связи должна быть та же, но "стандартная" отличается на ((2-1.48)/2)*100=26%

Так что кольцегранные модели вместе с результатами Годшмидта показывают, что точность "стандартных" межатомных расстояний порядка 25%. Понятно, что в некоторых случаях она может быть лучше, в некоторых хуже. Например, для молекулы позитрония Ps2 стандартное межатомное расстояние строго равно нулю, а кольцегранная модель показывает, что оно того же порядка, что в атоме водорода. Для молекулы позитрония ошибка "стандарта" бесконечна smile

http://img-fotki.yandex.ru/get/6208/126580004.4e/0_bad04_d2d8cfe0_M.gif
Оригинал: http://img-fotki.yandex.ru/get/6208/126 … 0_orig.gif

Скрипт для 3DS Max:

l = #(); ll = #(); lll = #(); llll = #();
m = torus radius1:7.6 radius2:0.05 segs:100 sides:12 position:[0,0,0] wirecolor:[0,0,255]
rotate m 90 [0,1,0]
move m [1.42*7.6 , 0, 0]
m.pivot = [0,0,0]
rotate m -35.27 [0,1,0]
rotate m 45 [0,0,1]
mm = copy m  wirecolor:[0,0,255]
m1 = instance m wirecolor:[255,0,0]
rotate m1 90 [0,0,1]
mm1 = copy m1 wirecolor:[255,0,0]
m2 = instance m1 wirecolor:[0,0,255]
rotate m2 90 [0,0,1]
mm2 = copy m2 wirecolor:[0,0,255]
m3 = instance m2 wirecolor:[255,0,0]
rotate m3 90 [0,0,1]
mm3 = copy m3 wirecolor:[255,0,0]
m4 = instance m3 wirecolor:[0,0,255]
rotate m4 90 [1,0,0]
mm4 = copy m4 wirecolor:[0,0,255]
m5 = instance m4 wirecolor:[255,0,0]
rotate m5 90 [0,0,1]
mm5 = copy m5 wirecolor:[255,0,0]
m6 = instance m5 wirecolor:[0,0,255]
rotate m6 90 [0,0,1]
mm6 = copy m6 wirecolor:[0,0,255]
m7 = instance m6 wirecolor:[255,0,0]
rotate m7 90 [0,0,1]
mm7 = copy m7 wirecolor:[255,0,0]
g1 = group #(m,m1,m2,m3,m4,m5,m6,m7)
g2 = group #(mm,mm1,mm2,mm3,mm4,mm5,mm6,mm7)
rotate g1 45 [0,0,1]
rotate g2 45 [0,0,1]
rotate g2 35.28 [0,1,0]
rotate g2 180 [1,0,0]
move g2 [1.42*7.6*2,0,0]
g2.pivot = [0,0,0]
rotate g2 -35.28 [0,1,0]
g3 = group #(g1,g2)
g3.pivot = [0,0,0]
rotate g3 35.28 [0,1,0]
for j in 1 to 500 do (
l[j] = box length:0.5 width:0.05 height:0.05 pos:[0.1*(j-1)-15,0,0] wirecolor: [0,0,0]
--ll[j] = box length:0.5 width:0.05 height:0.05 pos:[0.1*(j-1)-15,8.9,0] wirecolor: [0,0,0]
    )
for j in 1 to 500 by 10 do (
lll[j] = box length:1 width:0.05 height:0.05 pos:[0.1*(j-1)-15,0,0] wirecolor: [0,0,0]
--llll[j] = box length:1 width:0.05 height:0.05 pos:[0.1*(j-1)-15,8.9,0] wirecolor: [0,0,0]
    )

669

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 36

Victoria пишет:

А.Ю., ковалентные радиусы (половина межатомного расстояния) при разной кратности связи между атомами будут различны: например для одинарной связи С-С = 0.75, для двойной С=С = 0.67, для тройной = 0.60. В бензоле связи вообще полуторные. Это связано с тем, что атомы в разной степени вгрузают друг в друга, при этом их атомный радиус не меняется.

Кушелев: "атомы в разной степени вгрузают друг в друга" у тех, кто не дружит со здравым смыслом. В классической кольцегранной модели бензола, как и в других кольцегранных моделях, электроны "не вгрузают друг в друга":

http://nanoworld88.narod.ru/data/025.files/sld002.jpeg

И при этом межатомное расстояние неплохо соответствует длине "полуторных" связей. smile

670

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 36

Victoria пишет:

радиус электрона нужно рассчитывать, опираясь на значение атомного радиуса.

Кушелев: Нет. Наоборот, "стандартные" длины связей можно уточнить по кольцегранным моделям, а радиус электрона можно определить статистическими методами. Собственно это я и сделал, воспользовавшись программами PyMOL и RasTop. Кстати, Вы можете продолжить уточнение радиуса электрона. Ведь я подобрал его "на глазок" smile

http://img-fotki.yandex.ru/get/5600/126580004.40/0_b1ec9_623b0fe3_orig.png
Поэтому я указываю всего 2 значащих цифры, хотя вторая может быть вовсе не 7, а, например, 6 или 8 smile