941

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 34

Neophyte пишет:

А теннисный шарик, парящий в выходной струе пылесоса, тоже на ниточках висит?

Шарик я и сам могу в струе восходящего воздуха запустить. А самолётик, похоже на ниточке. Но, если у Вас получится без ниточки, буду очень рад. А пока не получилось, просьба не беспокоить smile

942

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 34

Сдвиг для альфа-кода настроен. Осталось настроить сдвиги для бета-кода, пи-кода и 310-кода. После этого можно будет вывести pdb-файл стебля белковой молекулы.

Напомню, что для гигантских белков скрипт уже сделан. Он выводит pdb-файл, в котором из каждой аминокислоты есть только один атом.

Все атомы для мелких белков выводит скрипт Савина-Кушелева. А стебель белка будет выводить этот скрипт "для средних белков" smile Его же позднее можно будет доработать и для вывода всех атомов белка. Напомню, что он на порядок компактнее скрипта Дениса Савина.

http://img-fotki.yandex.ru/get/6203/126580004.4a/0_b76f2_9006cb0d_M.gif
Оригинал: http://img-fotki.yandex.ru/get/6203/126 … d_orig.gif

Скрипт:

a = #(); b = #()
newmat = multimaterial name:"MyMultiMat" numsubs: (12)
newmat[1].diffuse = (color 0 0 250)
newmat[2].diffuse = (color 100 100 100)
newmat[3].diffuse = (color 100 100 100)
newmat[4].diffuse = (color 250 0 0)
newmat[5].diffuse = (color 0 0 250)
N1 = sphere radius:0.003 segs:20 pos:[0,0,-0.826] wirecolor:[0,200,255]; Converttomesh N1
p = #(1.364,0.954,-3.04,0,0,255,0,1.41,-2.24,100,100,100,0,1.7,-0.539,100,100,100,0,2.53,0.293,255,0,0)
for j in 1 to 24 by 6 do(a[j] = sphere radius:0.3 segs:20 pos:[p[j],p[j+1],p[j+2]] wirecolor:[p[j+3],p[j+4],p[j+5]]; Converttomesh a[j]
a[j].material = newmat[1+j/6]; attach N1 a[j])
q = #(1.92,0.585,-2.5,0.65,-0.42,0.65,0,0,255,2.06,0.68,-3.44,-0.792,0.317,0.5,0,0,255,1.59,1.48,-2.46,0.22,0.66,0.66,0,0,255
,1.03,0.27,-2.66,0.42,0.8,-0.47,0,0,255,1.73,1.57,-3.40,0.42,0.8,-0.47,0,0,255,1.17,0.36,-3.6,0.22,0.66,0.66,0,0,255   
,0.84,1.26,-3.56,0.65,-0.42,0.65,0,0,255,0,2.24,-2.24,0,1,0,100,100,100,0,1.69,-3.02,0,0.329,-0.94,100,100,100
,-0.674,1.69,-1.848,-0.81,0.2835,0.45,100,100,100,-0.674,1.136,-2.626,0.81,0.2835,0.45,100,100,100
,0,0.586,-2.24,0,1,0,100,100,100,0.674,1.686,-1.848,0.81,0.2835,0.45,100,100,100,0.674,2.039,-0.872,0.8,0.4,-0.4,100,100,100
,-0.674,2.039,-0.872,-0.8,0.4,-0.4,100,100,100,0.674,1.365,-0.198,-0.8,0.4,-0.4,100,100,100,-0.674,1.365,-0.198,0.8,0.4,-0.4,100,100,100
,0.674,2.867,-0.044,0.8,0.4,-0.4,255,0,0,-0.674,2.867,-0.044,-0.8,0.4,-0.4,255,0,0,0.674,2.193,0.63,-0.8,0.4,-0.4,255,0,0
,-0.674,2.193,0.63,0.8,0.4,-0.4,255,0,0,0,3.344,0.433,0,1,0.2,255,0,0,0,2.669,1.107,0,0.2,1,255,0,0)
for j in 1 to 207 by 9 do(b[j] = torus radius1:0.57 radius2:0.03 segs:30 sides:12 position:[q[j],q[j+1],q[j+2]] transform:(matrixFromNormal [q[j+3],q[j+4],q[j+5]]) wirecolor:[q[j+6],q[j+7],q[j+8]]; Converttomesh b[j]; attach N1 b[j])
rotate N1 35.28 [1,0,0]
angx=#(-24,180,60,-45,-45); angy=#(10.89167,-83,0,-15,-15); angz=#(92,120,60,110,110)
dx=#(1.05,1.5,1.6,2,2); dy=#(2.2,1,0.8,1,0.6); dz=#(-1.6,0,-0.6,-0.15,-0.45)
kk=#(1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1)
peptide=box length:0.01 width:0.01 height:0.01  position:[0,0,-.5] wirecolor:[250,250,250]; Converttomesh peptide
for k = 1 to 20 do(element = copy N1; attach peptide element; peptide.pivot = [0,0,0]
rotate peptide -angx[kk[k]] [1,0,0]; rotate peptide -angy[kk[k]] [0,1,0]; rotate peptide -angz[kk[k]] [0,0,1]; move peptide [dx[kk[k]],dy[kk[k]],dz[kk[k]]])
delete N1

943

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 34

Константин пишет:

Я провёл свою независимую экспертизу и установил

Кушелев: Несите скорее свою видеозапись Ярославу Петровичу!

944

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 34

Константин пишет:

Так видеозапись Старухин же и выложил, а я провёл экспертизу.

Ну так покажите видеозапись, как у Вас лично самолётик висит между вентиляторами. Иначе это не экспертиза, а пустые слова. Если не сможете повторить, то придётся Ваши сообщения удалить, как пустой трёп smile

Вот результат настоящей экспертизы:

http://img-fotki.yandex.ru/get/6102/126580004.4a/0_b79a4_fdb8ff75_orig.png
Ярослав в следующий раз может начать проверку достоверности с Яндекса smile

945

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 34

Вот этот фокус веселее будет: http://video.yandex.ru/redir/search/?ur … 0%BC%D0%B8

946

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 34

Кстати, на сайте Ярослава Петровича есть не менее впечатляющие видео, где пластмассовые модели белков вращаются "в невесомости" вообще без вентилляторов smile

http://video.mail.ru/bk/yaroslav2008/22/98.html

http://nanoworld88.narod.ru/data/216.files/0_48cd7_9d30f602_S.gif

947

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 34

Константин пишет:
Kushelev пишет:

Ну так покажите видеозапись, как у Вас лично самолётик висит между вентиляторами. Иначе это не экспертиза, а пустые слова.

Если это фокус и инопланетяне здесь ни причём, значит и круги на полях рисуют местные шутники с палками и верёвками. Логично? Согласен?

"Железная" логика wink

948

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 34

Константин пишет:
Kushelev пишет:

Вот этот фокус веселее будет: http://video.yandex.ru/redir/search/?ur … 0%BC%D0%B8

Если ты такой умный раскрой секрет этого фокуса или сам вот так вот пролезь через вентилятор. Не можешь? Не знаешь? А я знаю! Это инопланетяне протаскивают мужика своим невидимым лучом.

Секрет прост. Когда тушат свет, то видно только движущиеся огни. Банальная "ёлочная" гирлянда smile При этом вентилятор можно не просто выключить, а ещё и лопасти повернуть.

949

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 34

http://img-fotki.yandex.ru/get/5906/126580004.4a/0_b7b17_b4f5877b_S.gifhttp://img-fotki.yandex.ru/get/6103/126580004.4a/0_b7b35_b5684ddf_S.gifhttp://img-fotki.yandex.ru/get/6203/126580004.4a/0_b7b56_b3e6174c_S.gifhttp://img-fotki.yandex.ru/get/6103/126580004.4a/0_b7b9c_c12759e7_S.gif
Кушелев: Наконец, удалось смоделировать альфа-, бета-, пи- и 310-спирали белка, меняя единственный угол.

a = #(); b = #()
newmat = multimaterial name:"MyMultiMat" numsubs: (12)
newmat[1].diffuse = (color 0 0 250)
newmat[2].diffuse = (color 100 100 100)
newmat[3].diffuse = (color 100 100 100)
newmat[4].diffuse = (color 250 0 0)
newmat[5].diffuse = (color 0 0 250)

N1 = sphere radius:0.03 segs:20 pos:[0,0,-0.826] wirecolor:[0,200,255]; Converttomesh N1
p = #(1.364,0.954,-3.04,0,0,255,0,1.41,-2.24,100,100,100,0,1.7,-0.539,100,100,100,0,2.53,0.293,255,0,0)
for j in 1 to 24 by 6 do(a[j] = sphere radius:0.3 segs:20 pos:[p[j],p[j+1],p[j+2]] wirecolor:[p[j+3],p[j+4],p[j+5]]; Converttomesh a[j]
a[j].material = newmat[1+j/6]; attach N1 a[j])
q = #(1.92,0.585,-2.5,0.65,-0.42,0.65,0,0,255,2.06,0.68,-3.44,-0.792,0.317,0.5,0,0,255,1.59,1.48,-2.46,0.22,0.66,0.66,0,0,255
,1.03,0.27,-2.66,0.42,0.8,-0.47,0,0,255,1.73,1.57,-3.40,0.42,0.8,-0.47,0,0,255,1.17,0.36,-3.6,0.22,0.66,0.66,0,0,255   
,0.84,1.26,-3.56,0.65,-0.42,0.65,0,0,255,0,2.24,-2.24,0,1,0,100,100,100,0,1.69,-3.02,0,0.329,-0.94,100,100,100
,-0.674,1.69,-1.848,-0.81,0.2835,0.45,100,100,100,-0.674,1.136,-2.626,0.81,0.2835,0.45,100,100,100
,0,0.586,-2.24,0,1,0,100,100,100,0.674,1.686,-1.848,0.81,0.2835,0.45,100,100,100,0.674,2.039,-0.872,0.8,0.4,-0.4,100,100,100
,-0.674,2.039,-0.872,-0.8,0.4,-0.4,100,100,100,0.674,1.365,-0.198,-0.8,0.4,-0.4,100,100,100,-0.674,1.365,-0.198,0.8,0.4,-0.4,100,100,100
,0.674,2.867,-0.044,0.8,0.4,-0.4,255,0,0,-0.674,2.867,-0.044,-0.8,0.4,-0.4,255,0,0,0.674,2.193,0.63,-0.8,0.4,-0.4,255,0,0
,-0.674,2.193,0.63,0.8,0.4,-0.4,255,0,0,0,3.344,0.433,0,1,0.2,255,0,0,0,2.669,1.107,0,0.2,1,255,0,0)
for j in 1 to 207 by 9 do(b[j] = torus radius1:0.57 radius2:0.03 segs:30 sides:12 position:[q[j],q[j+1],q[j+2]] transform:(matrixFromNormal [q[j+3],q[j+4],q[j+5]]) wirecolor:[q[j+6],q[j+7],q[j+8]]; Converttomesh b[j]; attach N1 b[j])
angz=#(98.6,267,27,125,147)
kk=#(4,4,4,4,4,4,4,4,4,4,4,4,4,4,4,4,4,4,4,4,4)
peptide = copy N1
for k = 1 to 20 do(element = copy N1;  peptide.pivot = [0,0,0]
rotate peptide 29.7 [1,0,0]; rotate peptide 55.97[0,1,0]; move peptide [1,-2.3,1.6]; peptide.pivot = [0,0,0]; rotate peptide angz[kk[k]] [0,0,1]; attach peptide element)
delete N1

***
В процессе моделирования удалось определить угол ненапряжённых композиций 1(4) и 3. Теперь композиционный код будет состоять не из 4, а из 6 разных цифр. Пикотехнологическая модель пи-спирали говорит о том, что число аминокислотных остатков в ненапряжённой структуре около 6 штук на виток. Рибосома может формировать напряжённую пи-спираль с числом остатков 4.4, но ... не факт. Число остатков в пи-спирали, формируемой рибосомой нужно ещё проверить...

950

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 34

http://img-fotki.yandex.ru/get/6103/126580004.4a/0_b7bf6_368a265c_M.gif
Пикотехнологическая модель гормона панкреатической железы свиньи (фрагмент).
("Любимый белок" профессора В.Г.Туманяна) smile

Нужно учесть, что это только стебель белка и только фрагмент...