431

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 93

http://img-fotki.yandex.ru/get/2708/158289418.195/0_fc3b9_fb8aea95_orig.jpg
Кушелев: Фолдинг у Виктории, как я понял, это перевод углов из одной системы отсчета (ось тРНК) в другую систему отсчета (ось белковой спирали) smile

Но это кажущийся фолдинг, согласитесь. Вы поворачиваете аминокислоту вокруг одной оси, потом наклоняете эту ось и наблюдаете другой угол. Так же как с тетраэдром. Поверните тетраэдр вокруг вертикальной оси на 120 градусов, а потом наклоните, чтобы посмотреть вдоль ребра. И угол в 120 градусов "сфолдирует" в вашем сознании (но не в реальном мире) в угол 109 градусов 28 минут smile

https://img-fotki.yandex.ru/get/5403/158289418.4b0/0_188f48_a4656260_orig.jpg

https://img-fotki.yandex.ru/get/5306/158289418.4b0/0_188f49_7f0e9342_orig.jpg
Напомню, что тетраэдрический угол измеряется между нормалями к граням smile
180 - фи

432

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 93

aest пишет:

все октаэдры, октаэдры, а тут на тебе и возьмись непонятно откуда прямая как свеча спираль

Кушелев: Представьте себе, что прямую спираль можно изготовить в т.ч. и из октаэдров. Но аминокислоты имеют другую форму, состоящую в т.ч. и из октаэдров.

А Вы уже попробовали "согласованно изменить углы", чтобы спираль осталась прямой? wink

433

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 93

aest пишет:

Возьмите спирально закрученную серпантинку с новогодней елки, потяните за один конец => углы витков согласованно изменились, серпантинка осталась прямая big_smile

Конечно. Но при этом Вам пришлось изменить сразу все углы. А это приведёт не только к сохранению прямой формы спирали, но и к изменению ее длины. Помните про треугольник? Здесь "та же картина маслом, только вид сбоку". Если Вы измените длину спирали, "растягивая серпантинку", то у Вас шаг спирали уже не будет соответствовать экспериментальным данным. Поэтому все эти "согласованные изменения" нарушают соответствие модели и экспериментальных данных.

434

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 93

Kushelev пишет:
aest пишет:

все октаэдры, октаэдры, а тут на тебе и возьмись непонятно откуда прямая как свеча спираль

Кушелев: Представьте себе, что прямую спираль можно изготовить в т.ч. и из октаэдров. Но аминокислоты имеют другую форму, состоящую в т.ч. и из октаэдров.

Ну оси то параллельные есть, а вы настаивали, что нет. Хотя даже далекому от биологии человеку понятно, что есть, а Кушелев допускает очередную философскую ошибку big_smile Что уж говорить о Виктории, профи по биологии. Я же говорю, вы в расчете на недалеких "потенциальных инвесторов" и "менеджеров" в угаре забываете о том, что есть еще и проницательные люди, не стыдно ?

435

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 93

aest пишет:
Kushelev пишет:

Чтобы это понять, нужно посмотреть на тетраэдр сверху. Кажется, что между его гранями углы в 120 градусов. Но на самом деле в пространстве эти углы по 109 градусов 28 минут. Почему? А потому что они отмеряются не вокруг вертикальной оси, вдоль которой мы смотрим на тетраэдр сверху, а вокруг оси двухгранного угла, совпадающей с наклонным ребром тетраэдра.

Думаю вы слишком сильно недооцениваете Викторию и других биологов. Вам застилают глаза ваши амбиции..

А Вы за Викторию не пишите. Давайте у неё лично спросим про "фолдирование" углов 0,120,240 в углы альфа-, 310-, пи- и бета-спиралей.

436

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 93

aest пишет:

Ну оси то параллельные есть

Есть, но приближенно параллельные. В строгом геометрическом смысле их нет.

437

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 93

Kushelev пишет:
aest пишет:

Возьмите спирально закрученную серпантинку с новогодней елки, потяните за один конец => углы витков согласованно изменились, серпантинка осталась прямая big_smile

Конечно. Но при этом Вам пришлось изменить сразу все углы. А это приведёт не только к сохранению прямой формы спирали, но и к изменению ее длины. Помните про треугольник? Здесь "та же картина маслом, только вид сбоку". Если Вы измените длину спирали, "растягивая серпантинку", то у Вас шаг спирали уже не будет соответствовать экспериментальным данным. Поэтому все эти "согласованные изменения" нарушают соответствие модели и экспериментальных данных.

Вы тут мне про шаг не втирайте теперь, в условии задачи шага не было, только сломалась/не сломалась и согласованное изменение углов. Так что очередная философская ошибка от Кушелева, очередная лужа, ай яй яй.

438

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 93

Kushelev пишет:
aest пишет:

Ну оси то параллельные есть

Есть, но приближенно параллельные. В строгом геометрическом смысле их нет.

Это с чего это ? Из-за несовершенства мира ? Если в 3д максе построите, будут вам и строго геометрически wink

439

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 93

aest пишет:

Это с чего это ? Из-за несовершенства мира ?

Нет. Просто в той же альфа-спирали угол не целочисленный, а трансцендентный. Поэтому даже при 1000 витках не будет ни одной пары параллельных осей.

440

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 93

Kushelev пишет:
aest пишет:

Это с чего это ? Из-за несовершенства мира ?

Нет. Просто в той же альфа-спирали угол не целочисленный, а трансцендентный. Поэтому даже при 1000 витках не будет ни одной пары параллельных осей.

Тогда параллельны не будут, но это только если все углы между осями остатков такие. А все ли они такие или нет мне неизвестно.