1

Тема: Белковая спираль Моцарта-Кушелева

Формы, механизмы, энергия наномира. Сообщение 87 120

Пикотехнология белков, ДНК, РНК - 2

Белковая спираль Моцарта-Кушелева

https://img-fotki.yandex.ru/get/25939/158289418.3fc/0_178174_314dcbb0_orig.png

IDDIDDIDDV

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/25 … ZJ2D64R013

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/255722494

>ENA|XP_002546182|5175 nucleotides
atggccaaaaaggaaaagaatgataagaccataggagatccattcaatcgcagttcagac
gacaatatgagtattcaagatgcagaggatcaagattcaagtgataacgaagaagaatca
ttgataagactatctatgcaagcacaacacagaagaacatctaagaatcaatacaatagt
gatagcgatagaggaagtgttgaatttgaagaagtagctaatgttcccggcatagatgat
agcatagaggaagaactcattgctgaagaggatgatgagaatgatgatgacgaagaagaa
gatgaatttgatgacagtcatgattcgcacgaccatagtggcgattttgagggagatgag
gaagatgaactaggcatgatggaaacttctgatttcttacgtcgtttaattcaaggtaga
agagtaagaactactgaaattccaacttcaggtggcgataatgctgacagatactcaaga
aattctcatagccaaagtcatgatgatgacgacgatgacgagatgaacgatattgatatt
gatgatgatgatgacaacgatagaaacagagaaagaagagatcgcggagaagaagaagaa
gaagaagaagacgacggagaagatgacgatgatgaagatgacgatcctcgtgccgaattt
ttgagagcaataggcgcactcgctggtggtggaaatagaaatggaaatgatgcagaaaat
tctactggtaacggatttgtagatgtcatgcaaagactaatgggcggtggtataatattt
gatggtggatcagcccgtgatggtggtgagttagatgcattagtaaataacttgagtcaa
agagatgatacttacataattcttgagtcattaaacgagttgagtgaaagattattgatg
atgaatggtttaaccgcagagagactaattccagcaaataaactagcaaagaatcttgtt
gatataatggaagatcctaaactagatgaagaattggaattgcatttagttgcttgccga
tgcttgtataattttttggaggttaaccaagatttcatccatgatgctttgaataataac
gccatcccagcattatgcaacaagttgttggaaatcaagtacattgatttaacagaacaa
gcattgcaaactttggaaatgatctccagggatcctatttctcacaatagcattgtgtca
cataatgggcttactgcatgtttacaatatttggatttcttgacaatacatgcccaaaga
aaatgtttaaccattgtctcaaattcatgtactaatatctccattgccaatttccctaag
atcaaagacgctttcagcagtattgcagaagttgttagaaattataatgataaaattgtc
gttgaaaatgcatggttgactatctcaaggataataatgtgttttaaaaacaaacccgag
ttattgaatgaactattcgcagataaggagttacttttgaaggagttgacgaaagttatc
tggctcagttgtaacaaatcactgaatactggttctgaatcaagtcaagtgacattgaat
tacggttccaatttgagtttaatcaaatcattaattgtattggccagtgtgagtgttgat
gtttctagaattttaatcaccgaatgtaatattgggtcagtgatagttaagtctttgaat
aaatattctaaacaaagtcctgatgttgatttatctggaacagaaaacatctcgattgaa
gctttaatgtccgctccaaaggatttgaattcccagtttttgagtttaattggttatttg
ttaccaataacatattcaccagcagaggcattatatttaagaccaaactttgaagaagat
gaagaacgtaaagctatcaatcagtcaagaattgaattatgcaaagatattataccaaag
gaatattggaagtttgtaaatgagatttggtcattattaattctcagttttcaagcaact
atggattttgaaattcgaagaaaaagttttattaatttataccgtattattaattccaat
tctaacgacttttctgttattaaagatgtcgatgagattgctgggctattagcaaacgtt
gtcaaccagtatcaatcaatagtcacgaaagattttgctaatgcgcaaaaggaagatgaa
gatatgattcaaagtgatgatgaacacgaccatgggaatgaacatgaacatgaacatgac
attgatgacattgatgacattgatgacgttgatgatgataatgacgacgacgatgacgat
gatgctgatggcgagacttacacatcaactttacgtggaagagatttatcacacgcccga
tacagtagtaactctacaaggggtgctcctgaagatacaaataaactcaacgcattgatg
ttgctttttagtgcattgaaaataatcaaggttttgcttgaaaaagctccatttatattc
attggcgcatttgagaaagaaggtcttatcaatgatgtgcttctattatccactcaatta
gaaggtaaggttcaagtcgatcaaccagatccaagatcaactttaaattctatgatgact
gcatattcaaataaatatatcgatagtgaattcaccaaggagtatgaattcagattatcg
agtagtgttatttactccaacatattatttattgctaccgctattgatagtttatacaat
gaaggcaaagatatcggttcccagatcgtttccgacaacatgagagtattacaggacatt
aaagtaacgttgtctgatagcaagagaatcaagtcatttagttatgaagaatggtcatca
ttatgggataacttcaaactggttttttctggttcgtcatccatatctagttttgaatta
atttcctccggcataatagagcttttaacgaagtttctcagcatggaacaaggagtcggg
tgtaatgactgttacctctcattcaagaatgcatttttccatgatcaatccgggaaaata
cttgtacataaattgcaagaatcattaacgagatctgaatcgtttgacattgtttctgca
aattcaaatagcagtcaatcaacatatatccgtgaacaaaaccaagcttcaataatggca
aatcaaatcaagttaaagttaattgcggaaaatgattccgatgacctgcagcagctttca
cgaattccaggcaacatgcaaaatatggttttatcagttcatgccattgctaccttcaag
tcgatatttgcattcttaaaacaaagatttaagtttattgaagaaattggttcacttact
agagctaataatcacgatggcacgaacgatgataatgataacaccgatgaagatggtgaa
agaaagtcggagttgaatattgaatttttgatcaacggagaagtcataccaaacgagacc
accatttatggtgcaatttatcgctcattgcaagacaaaccggacgaaataatcgaccca
agcagaatttggtcatctattcacaacatttcatatagaaaaatcagttctgaagtcagc
aaggaaaatccatttacaaactttgctttacaaaatactgacagcgaattaaatgcttat
gatggcaccaccatcagtattttgaaattattgaatgacttgtatcatatgaacatcaat
actggagcggtgccgaataaagatttcactaattggaaattgactgttaagttgaataga
caattggaagagccattagttgttgcaagtggaacattgccaggatggagcattcattta
actaaaagatttccattcatatttccattggaaaccagaatattctttttgcagtcaact
tcatttgggtattcaagattgatccaccaatggcaattacgtacaaaccaaggtaacgaa
gagaacggtaactcgaataacaacccacatggtaatcaaagattacaattgggtagacca
acaagacataaggttagaatatcaagaaaaatgatgttgcaaagtgcagtgaaagttttg
ggaatgtatgggtctacaccaagtatactagaaattgaatattttgatgaggttggtact
ggtttaggtccaactttggaattttactcgactgtatctaaagaattttccaagaaaaag
ttgaaattatggagagatgaggaacctggtgctgcggatgacaatgcatatgttgtaaat
aaacaaggattgtttccaatgccaatggataaatcccagattgccagtgagaatggtaga
aaagtgttgtacttttttgcttccttagggaaatttattgcccgagcactattggattct
agaatcattgattttaatttcaaccttgttttcttgctgttgattcaaatgttgaacaag
aattatggcggttcgtccaaaagttcacaacaaaaattgctaaagtcaatggctaattta
aacaaattacgtgttgttgatcccggattagctgattcattagagcatttgtataaatat
gtgaaacagttcaaaaattgtgaagatattcatcaagttaccgttgatggagcaacagtt
caagatttggcattatttttcgagttaccagggaatccagattatgaattgattcctaat
ggtggaaatactccagttactgcagaaaatttagaactttatctcaacaaagtccttgaa
gctactttatattcgggtattattaatcagactaaagcgtttatggaagggttttccaaa
gtattcccaatcaactcattgataatattctccccacctgaattggttgaattatttggt
aatgctgaagaggattggtcatatgatagtttaacttcaggtattattgccaatcatgga
tacacaaaggaatcaccagcaatcaagtcattaattaatatattggttaatttcgataaa
gatgaaaagagagaatttttgcaattcttaacaggggctccgaaattgccaattggagga
tttaaagcattaagacccgaattgactgttgttagaaaacatgctgaagacgggttaaaa
gatgatgattatttaccaagtgtcatgacatgtgccaattatttgaaattaccaaattat
tcaagtgaaaaagtaatgaaagacaaattactaaaagctattagagatggtgctggagct
ttcttattgtcataa

https://img-fotki.yandex.ru/get/197923/158289418.3fb/0_178160_44ae512b_orig.png

Развернуто: https://img-fotki.yandex.ru/get/177902/ … 8_orig.png

Фрагмент:

https://img-fotki.yandex.ru/get/197741/158289418.3fb/0_178163_2a74bcaa_orig.png

https://img-fotki.yandex.ru/get/212758/158289418.3fb/0_178162_fb43c4ec_orig.png

Получился неполный виток спирали. Давайте нарастим спираль до нескольких витков:

https://img-fotki.yandex.ru/get/57797/158289418.3fb/0_178165_303cd6ab_orig.png

https://img-fotki.yandex.ru/get/48807/158289418.3fb/0_178164_2c56d0d_L.png

https://img-fotki.yandex.ru/get/48807/158289418.3fb/0_178166_150beb15_orig.png

https://img-fotki.yandex.ru/get/42692/158289418.3fb/0_178167_9b250c9f_orig.png

https://img-fotki.yandex.ru/get/169451/158289418.3fb/0_178168_3b1d40fb_orig.png

https://img-fotki.yandex.ru/get/194588/158289418.3fb/0_178169_7b0e1347_orig.png

https://img-fotki.yandex.ru/get/196121/158289418.3fb/0_17816a_c2980d29_orig.png

https://img-fotki.yandex.ru/get/196365/158289418.3fb/0_17816b_be2c5015_orig.png

https://img-fotki.yandex.ru/get/42692/158289418.3fb/0_17816c_74555147_orig.png

https://img-fotki.yandex.ru/get/55195/158289418.3fc/0_17816d_c353bddb_orig.png

https://img-fotki.yandex.ru/get/231315/158289418.3fc/0_17816e_c436c3fc_orig.png

https://img-fotki.yandex.ru/get/56796/158289418.3fc/0_17816f_ecb4dce5_orig.png

https://img-fotki.yandex.ru/get/194588/158289418.3fc/0_178170_19d6957e_orig.png

https://img-fotki.yandex.ru/get/231315/158289418.3fc/0_178171_9dc735f8_orig.png
Спираль Моцарта-Кушелева (533-спираль) интересна тем, что на один виток приходится почти 14 аминокислотных остатков. При этом спираль имеет ось симметрии ~5 порядка.

Любопытно и то, что композиционный код сдвинут относительно музыкального (и первичной последовательности), т.е. разным нотам соответствует одинаковая композиция соседних аминокислотных остатков и в то же время разные углы поворота соответствуют одинаковым нотам. Более того, третья нота, как и в 40-ой симфонии Моцарта звучит вдвое дольше второй!

https://img-fotki.yandex.ru/get/479589/158289418.3fc/0_178175_12f1e36b_orig.png
Это связано с тем, что вторая нота соответствует коду альфа-спирали, когда нет вращения транспортной РНК, а третья нота соответствует коду пи-спирали, когда тратится время на дополнительное вращение тРНК.