1

Тема: Музыка добелкового мира. 50 000 000 000 000 лет назад

Формы, механизмы, энергия наномира. Сообщение 86 972

Пикотехнология белков, ДНК, РНК - 2

Музыка добелкового мира. 50 000 000 000 000 лет назад

50 триллионов лет назад по биологическим часам...

Музыка ДНК ещё не определена, а кто-то уже продаёт "ДНК-шкатулки": https://www.youtube.com/watch?v=8PmimfEYz3g

А что на самом деле представляет собой музыка ДНК/РНК?

Понятно, что при сборке белковых молекул отзванивают радикалы аминокислот. Но при добавлении нуклеотидов тоже звучит музыка в том же гиперзвуковом диапазоне. Давайте попробуем рассчитать частоты собственных колебаний нуклеотидов по той же формуле Томсона, по которой в 1993-ем году мне удалось рассчитать относительные частоты аминокислотных радикалов.

Формула: Частота равна обратной величине квадратного корня
из суммы произведений массы каждого атома на его расстояние
до точки закрепления.

Здесь данные и расчет резонансных частот аминокислот: http://www.nanoworld.org.ru/data/01/dat … 930219.htm

Давайте по той же методике рассчитаем частоты для нуклеотидов ДНК/РНК

ACGT - 4 нуклеотида ДНК и столько же нуклеотидов РНК. Массы нуклеотидов ДНК и РНК разные, следовательно нот может получиться 8. Но это только основных нот. Ведь в ДНК/РНК встречаются и другие нуклеотиды:

http://nanoworld88.narod.ru/data/228_files/0_4854b_e7cfcf19_XL.png
Подробнее: http://nanoworld88.narod.ru/data/228.htm

Для начала сделаем упрощённый расчёт. Дело в том, что нуклеотиды состоят из одного атома фосфора, большого количество атомов углерода и небольшого количества атомов азота.
Атомная масса
H 1
C 12
N 14
P 31

Атом фосфора фактически является точкой стыковки нуклеода, поэтому его масса мало влияет на частоту собственных колебаний. Больше всего влияет масса азотистого основания. Именно азотистыми основаниями главным образом и отличаются нуклеотиды друг от друга. Дополнительная OH-группа в РНК понижает частоту. Интересно, на сколько? С этого момента интересно начать оценку относительных частот нуклеотидов.

Для ДНК масса А складывается из 17 углеродоподобных атомов, а для РНК - из 18. 18/17=1.06 (округлённо). До 3 знака это отношение совпадает с музыкальным полутоном! А это значит, что нуклеотиды РНК "звучат" но пол тона ниже, чем нуклеотиды ДНК.

Теперь давайте разберёмся с относительными частотами ACGT.

https://img-fotki.yandex.ru/get/169883/158289418.3f3/0_17794d_a495889f_orig.gif

Для ДНК:

10 атомов аденина + 7 атомов дезоксирибозы = 17
8 атомов цитозина + 7 атомов дезоксирибозы = 15
11 атомов гуанина + 7 атомов дезоксирибозы = 18
8 атомов тимидина + 7 атомов дезоксирибозы = 15

Для РНК:

10 атомов аденина + 8 атомов рибозы = 18
8 атомов цитозина + 8 атомов рибозы = 16
11 атомов гуанина + 8 атомов рибозы = 19
8 атомов урацила + 8 атомов рибозы = 16

Музыкальный ряд получается из 5 нот:

15
16
17
18
19

Эти ноты лежат на шкале частот примерно на октаву ниже, чем ноты аминокислот. Более точное взаимное отношение нот белкового и добелкового миров ещё предстоит рассчитать...

https://img-fotki.yandex.ru/get/97884/158289418.3f3/0_17794e_1abda50b_orig.png
Так может звучать типовой процесс сборки фрагмента ДНК. Процесс транскрипции звучит на полтона ниже.

2

Re: Музыка добелкового мира. 50 000 000 000 000 лет назад

Формы, механизмы, энергия наномира. Сообщение 86 973

Пикотехнология белков, ДНК, РНК - 2

Музыка добелкового мира. 50 000 000 000 000 лет назад

Skype, 2017-04-08:

[11:23:58] Va12220(Valqwa): Саша, продолжить сможем в воскресенье к вечеру.
[11:25:21] Кушелев Александр Юрьевич: Ура!
[11:25:31] Кушелев Александр Юрьевич: Теперь на очереди МИДИ
[11:27:10] Va12220(Valqwa): на самом деле
- оптимизировать вывод html и html3 - долговато на мой взгляд
- дописать чтение dne
- миди
и её что-то
[11:28:12] Кушелев Александр Юрьевич: ОК
[11:28:18] Кушелев Александр Юрьевич: Видел, что творится? http://nanoworld.org.ru/topic/1661/
[11:29:12] Кушелев Александр Юрьевич: Так что миди желательно сделать, как и в случае с triplet-html два варианта. Белковую и ДНК
[11:30:18] Кушелев Александр Юрьевич: Сначала сборка ДНК звучит по-своему. Потом процесс транскрипции ДНК -> РНК звучит на полтона ниже, причём комплементарно (надо уточнить, с реверсом или нет?) А потом уже звучит музыка процесса трансляции (сборки белка) smile
[11:34:02] Кушелев Александр Юрьевич: Интересно сохранить миди-2, где сначала звучит сборка ДНК, потом процесс транскрипции, а потом уже сборка белка. Но это для второй версии.

3

Re: Музыка добелкового мира. 50 000 000 000 000 лет назад

Формы, механизмы, энергия наномира. Сообщение 86 974

Пикотехнология белков, ДНК, РНК - 2

Письмо Дидье Маруани / Didier Marouani от Кушелева

Музыка добелкового мира. 50 000 000 000 000 лет назад

Complement-reverse-midi-converter

[13:46:02] Кушелев Александр Юрьевич: Кстати по поводу "и ещё что-то". Есть идея сделать complement-reverse-midi-converter
Алгоритм очень простой. Нужно заменить ноты с номерами MIDI n на ноты с номерами MIDI 140-n
А во второй версии добавить возможность проигрывания наоборот, т.е. ноты с порядковым номером n заменить на ноты с порядковым номером N-n

Letter to Didier:

Hello, Didier! I have new idea:
Complement-reverse-midi-converter
The algorithm is very simple. It is necessary to replace notes with MIDI-numbers n to notes with MIDI-numbers 140-n
And in the second version to add the ability to play the opposite, i.e. Notes with the serial number n are replaced by notes with the serial number N-n
Details: http://nanoworld.org.ru/post/86311/#p86311

Warm wishes,
Your Alexander Kushelev