11

Re: Дирижер добелкового мира или прабабушка рибосомы.

Victoriy пишет:
Kushelev пишет:

Формы, механизмы, энергия наномира. Сообщение 94 188

Victoriy пишет:

C Рождеством, форумчане!

https://drive.google.com/open?id=1EiYC3 … soScEek_mJ

И Вас с тройным Рождеством!

http://nanoworld.org.ru/post/98480/#p98480

Уважаемая Виктория!

Подскажите, пожалуйста, существуют ли молекулы РНК, которые могут выполнять функцию РНК-полимеразы?

Мне такие РНК не ведомы, но известны рибозимы — это молекула РНК, обладающая каталитическим действием аутокаталитического расщепления, т.е. обратный эффект не синтеза как у РНК-полимеразы, а расщепления РНК саму себя в ходе сплайсинга. Посмотрите здесь http://humbio.ru/humbio/genexp/000f5f6f.htm

Кушелев: Об автосплайсинге я знаю, но меня интересует именно аналог рибосомы добелкового мира. РНК, которая формирует 2D-структуру РНК по нуклеотидной последовательности.

Дело в том, что известны белковые РНК-полимеразы, которые формируют первичную и, вероятно, вторичную структуру РНК, но в добелковом мире их, вероятно, ещё не было, т.е. функции белковых РНК-полимераз должны были выполнять специализированные РНК. Вот их-то я и ищу...

12

Re: Дирижер добелкового мира или прабабушка рибосомы.

http://humbio.ru/humbio/genexp/000f5f6f.htm

Цитата: В связи с рибозимами следует вспомнить и о РНКазе Р E. coli , состоящей из небольшого полипептида и РНК длиной в 375 нуклеотидов. Именно РНК обеспечивает этому ферменту эндонуклеазную активность, необходимую для процессинга предшественников тРНК.
Конец цитаты.

Кушелев: Ага... Похоже, что РНКаза - это и есть аналог РНК-полимеразы из добелкового мира. РНКаза осуществляет процессинг предшественников тРНК, но аналогичная РНК может осуществлять процессинг и других РНК, которые могут относиться к добелковому миру.

https://img-fotki.yandex.ru/get/369167/158289418.4bd/0_18ab30_7dd5ead8_orig.jpg

13

Re: Дирижер добелкового мира или прабабушка рибосомы.

Кушелев: Интересно проследить связь нуклеотидных последовательностей некодирующих белок РНК, которые вырезаются из структуры РНК со структурой РНК. Если такая связь будет надёжно установлена, то можно будет говорить о подтверждении гипотезы существования композиционного генетического кода добелкового мира.

14

Re: Дирижер добелкового мира или прабабушка рибосомы.

Формы, механизмы, энергия наномира. Сообщение 94 409

Пикотехнология белков, ДНК, РНК - 3

Дирижер добелкового мира или прабабушка рибосомы.

Составляем таблицу композиционного кода добелкового мира

Уважаемая Виктория! Не желаете принять участие в определении таблицы композиционного кода добелкового мира? Моих ресурсов явно не хватает для этой работы.

На данный момент я предполагаю, что прямые участки вторичной структуры РНК могут кодироваться повтором AAAAAAAAAAAAAAAAAAA...

Ещё у меня есть гипотеза, что тРНК, которая имеет 4 или 5 участков двойной спирали кодируется квази-перевертышем, в состав которого входят несколько повторов типа АААААААААААААА... О том, что в геноме есть всевозможные повторы и перевертыши, я уже прочёл. Однако находить нуклеотидные последовательности, которые могут кодировать вторичную структуру РНК, я ещё не научился.

Кстати, таблица композиционного генетического кода добелкового мира будет очень в тему нашей второй книге "Пикотехнология ДНК/РНК".

Я предполагаю, что таблиц композиционного кода добелкового мира будет составлено несколько. Ведь для белкового мира их у меня уже две (одна - для большинства прокариот и эукариот и вторая для митохондрий). А мы с Вами знаем, что даже простой генетический код отличается для некоторых организмов. Понятно, что композиционный генетический код добелкового мира тоже будет отличаться и для разных организмов, и дла разных органелл эукариот.

Кстати, к определению таблиц композиционного генетического кода добелкового (и белкового!) мира могут подключиться все желающие...

http://img-fotki.yandex.ru/get/5502/nanoworld.202/0_4840b_b2101c2f_orig.gif

https://img-fotki.yandex.ru/get/106972/158289418.3c5/0_1713fb_cf7f7637_orig.png