911

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 93

Татьяна Рясина пишет:

Презентационные сайты Лаборатории Наномир
https://ruby-em-drive.nethouse.ru
https://eternal-youth-technology-geneti … ethouse.ru
https://picotechnology-of-proteines.nethouse.ru
https://hi-tech-kushelev-group.nethouse.ru
https://nanoworld-cooperation.nethouse.ru
http://nano-wrld-articles.nethouse.ru

Для ознакомления новых людей и углубления знаний у осведомлённых.

Татьяна, приятно наблюдать за вашим нескончаемым энтузиазмом, но мой совет не стоит на данном этапе развития веб-технологий плодить кучу этого "веб-мусора". Такая подача материала в сети с 99% вероятности отпугнет любого серьезного человека из тех немногих, кто хоть как-то способен проявить интерес к проектам А.Ю. Эти ваши "сайты" - это галимый ужас эпохи начала развития интернета... Есть такое правило позитивного бездействия, которое можно описать простыми словами: лучше не делать в данном случае ничего чем делать таким образом. Вот примерно посмотрите как должны быть представлены серьезные проекты расчитанные на привлечение коммерческого интереса в 21 веке: https://www.gyrosproteintechnologies.com/

Вы же по современным реалиям плодите кошмар и пытаетесь замусорить интернет этим доисторическим спамом. От того, что вы наплодите вот таких "монстров" результат будет строго отрицательный. Создать за тоже время 1 адекватный сайт так же на человеческой бесплатной платформе с нормальным шаблоном - это в разы эффективнее и привлечет не придурков которые просто в голос ржать будут над вами, а серьезных людей. И зачем вы льете все в кучу? Пикотехнологию для серьезных задач и нааааааааа вам тут снизу видео квартиника с пианино? Хотите дальше клоунаду поддерживать?

912

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 93

Нужно минимум информации и качественная подача. Эти простыни текста никому не нужны! Вот вы машину хотите купить, зайдете на сайт продавца, а там тонны текста про то как машина устроена, чертежи, фото машины в разрезе и.т.д... Вот тут примерно так же. В 21 веке важен результат, а не как все устроено внутри. Минимум текста и красивое представление. С кнопкой ПОПРОБОВАТЬ СЕЙЧАС! Все, больше ничего не нужно. Все тексты "сложные" прячутся в маленькие подменю в футере откуда уж если кто-то и захочет что-то почитать докопается до них. Надо ЗАЯВЛЯТЬ про преимущества и кратно! Типа: Эффективность на 1000% выше, скорость в 500 раз быстрее! Все! А не расписывать все километрами текста, ну дайте денег, ну попробуйте, ну прочитайте тут всего миллиард знаков текста и и т.д...

913

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 93

Если нужен сайт просто для нищих ботаников и для "поржать", то да ваш вариант подойдет. Если нужно привлечь потенциальных клиентов, возможных инвесторов и серьезных людей, то это просто адский треш и веб-атавизм. У меня даже слов нет, какой это ...ец. Это бомжпакет на задворках вселенной. О какой репутации можно говорить, такие вот "сайты-презентации" загонят любой проект в анальные аналы...

914

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 93

Не обижайтесь, Татьяна , но это объективная правда, кстати вот тут (https://nanoworld-cooperation.nethouse.ru/) впринципе с "мордой" более менее все гуд, это можно оставить для начала, но дальше по ссылкам просто ужас.

915

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 93

Kushelev пишет:

Только что побеседовали по скайпу с Викторией Соколик (1 час 57 минут), в результате чего разобрались с осями, вокруг которых вращаются аминокислоты. Короче, по коду пи-спирали у Виктории получается пи-спираль без фолдинга. Разногласия уменьшились до вопроса кодирования 310-спирали. Виктория считает, что замена кодов альфа-спирали на коды 310-спирали (из моей таблицы) друг на друга не влияют на сборку правой спирали, которая будучи собранной из многогранников имеет угол 310-спирали. Превращением 310-спирали в альфа-спираль "заведуют радикалы аминокислотных остатков". Я считаю, что альфа-спираль и 310-спираль кодируются разными композиционными кодами и радикалы тут ни при чём. В качестве примера я предлагаю рассмотреть разные структуры поливалинов:

https://img-fotki.yandex.ru/get/509292/158289418.4a7/0_186c5c_1ebe5075_XL.png

Приятно читать хорошие новости. Спасибо!

916

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 93

Daren пишет:

Не обижайтесь, Татьяна , но это объективная правда, кстати вот тут (https://nanoworld-cooperation.nethouse.ru/) впринципе с "мордой" более менее все гуд, это можно оставить для начала, но дальше по ссылкам просто ужас.


Дарен, да. Спасибо!

Лендинг он и есть лендинг.

Дествительно, по темам можно сделать лендинги.  Лендинг мне просто подсказал С. Я не знала об этом.

Дарен, пожалуйста, сделайте по Пикотеху лендинг, Ваш вариант, на Nethouse.ru. Без картинок или почти без картинок.  Просто интересно, как это Вы можете сделать.

Я-то сделаю, но - нужен новый не-за-мыленный взгляд. У Вас в голове есть чёткий посыл. Потратьте полчаса Вашего времени или сутки, чтобы сделать как надо.

У потратила  год, чтобы вникнуть в первом чтении в разработки и год, чтобы их "компактно" изложить.

У Лаборатории Наномир - гигантский массив информации. Я занималась сжатием этой информации в одну страничку.

Всё равно иерархия сжатия присутствует. После ледингов выведут краткие ресурсы, которые ведут на более массивные, которые ведут на Форум, который ведёт к Энциклопедии Наномира.

917

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 93

А вообще-то.

Эйнштейн, синтезированная звезда релятивизма, играл на скрипке.

Кушелев , настояшая звезда науки, играет фортепианную пьесу с профи. Это круто.


И вы кое-чего не заметили. Никто не заметил. И я тоже. Но вдруг, присмотревшись, увиделся поворот.

Как только появились сверхдлинные спирали год назад, я сделала первый сайт (который Вам не наравится), и по СМС разолала авторам статей из МФТИ, которые здесь фигурируют.

С тех пор по поиску Гугл - структура белка KR2 - год висят диаграммы Пикотехнологии этого белка, 2D и 3D, вверху списка.

Продолжение следует.

918

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 93

Формы, механизмы, энергия наномира. Сообщение 93 918

Пикотехнология белков, ДНК, РНК - 3

Формы, механизмы, энергия наномира. Сообщение 93 855

Skype, 2017-12-25:

[24.12.2017 21:12:51] Кушелев Александр Юрьевич: Здравствуйте, уважаемая Виктория!
[24.12.2017 21:13:35] Кушелев Александр Юрьевич: Как Вы относитесь к идее сделать доклад, написать статью, опубликовать каталог на тему: "Определены структуры всех белков человека" ?
[24.12.2017 21:13:59] Кушелев Александр Юрьевич: http://nanoworld.org.ru/topic/1887/
[24.12.2017 21:15:05] Кушелев Александр Юрьевич: В качестве приложения можно дать ссылку на все структуры, определенные по разным таблицам композиционного генетического кода.
[24.12.2017 21:16:14] Кушелев Александр Юрьевич: При этом часть белков по таблице Виктории Соколик и Александра Кушелева полностью совпадут. Их можно не дублировать.
[24.12.2017 21:17:28] Кушелев Александр Юрьевич: Можно предложить всем желающим составить собственную таблицу композиционного кода и сравнить результаты определения структур по разным таблицам.
[24.12.2017 21:17:49] Кушелев Александр Юрьевич: Мне, например, без разницы, какая таблица окажется более правильной.
[0:43:17] Виктория Соколик: Добрый вечер, Александр Юрьевич. Из Вашего обращения я не поняла, что Вам надо: доклад, статью или каталог структур? Это разные и по назначению и по объёму вещи. И ещё вопрос: где Вы намерены размещать эту информацию? Под каждый ресурс делается специальный проект, Вы ведь должны это понимать.
[0:44:28] Виктория Соколик: И ещё: прежде чем браться писать о "структуре"! уточняйте вторичной "всех белков" надо ещё внимательно на неё посмотреть.
[0:49:15] Виктория Соколик: Не в обиду будет сказано, но Ваши аппетиты и методы решения ГЛОБАЛЬНЫХ задач напоминают мне проповеди проповедников, которые учат любить весь мир, не умея полюбить даже одного человека. Это я к тому, что важнее определить 3D-структуру десятка, но очень нужных и перспективных белков, чем 2D-структуру всех подряд.
[0:51:20] Виктория Соколик: ***** и посмотрим на Ваши ВСЕ БЕЛКИ. smile

[3:07:09] Кушелев Александр Юрьевич: Благодарю! Что и где размещать - это Вам решать. Вы же разместили книгу "Пикотехнология белков". Я считаю, что это самое правильное Ваше решение. А это значит, что Вы сможете решить, что лучше сделать: Доклад на конференции, статью в научный журнал или небольшую книгу-каталог, например, в то же издательство, что и книга "Пикотехнология белков".
Безусловно надо написать "вторичной и выборочно третичной и даже четвертичной". Можно показать пространственные модели ключевых белков. Таких как фундаментальные альфа-310-бета-пи-спирали, программные спирали типа коллагена и наиболее интересные структуры из генома человека. Как выяснилось, каждая хромосома кодирует до 10 белков, представленных преимущественно программными спиралями. Музыка их сборки напоминает народные мелодии: http://nanoworld.org.ru/topic/1699/page/78/
Дублирую по скайпу одну из таких структур:

https://img-fotki.yandex.ru/get/896349/158289418.4b9/0_18a0fd_f166188_orig.png

[3:10:09] Кушелев Александр Юрьевич: Очень зрелищными будут 6 циклов разных лизоцимов, которые замкнулись через дисульфидные мостики. Есть и ряд других белков, которые имеет смысл показать читателям/слушателям. Короче, давайте обсудим и сделаем, как проще и лучше. Лучше Вас вряд ли кто-то это сможет.

[25.12.2017 20:44:13] *** Пропущенные звонки от Виктория Соколик ***
[25.12.2017 21:57:55] Кушелев Александр Юрьевич: Добрый вечер, Виктория! Вы звонили?
[25.12.2017 21:58:56] Виктория Соколик: Да, Вы хотите побеседовать?
[25.12.2017 21:59:16] Кушелев Александр Юрьевич: Давайте через 30 секунд
[25.12.2017 22:00:04] Кушелев Александр Юрьевич: Вы звоните или я?
[25.12.2017 22:01:16] *** Звоним Виктория Соколик ***
[25.12.2017 23:58:54] *** Звонок завершен. Продолжительность: 1:57:39 ***
[26.12.2017 10:46:57] Кушелев Александр Юрьевич: Уважаемая Виктория! Разрешите разместить нашу вчерашнюю дискуссию на форуме с иллюстрациями и аудиозаписью. Я думаю, что участникам и читателям форума лаборатории Наномир будет интересно узнать, что углы пи-спирали и 310-спирали в наших с Вами моделях совпадают уже на уровне геометрического алгоритма. Что касается различия кодирования альфа- и 310-спирали, то это уже мелкие нюансы, т.к. угол альфа-спирали 97...100 градусов отличается от угла 310-спирали 119...121 градус всего градусов на 20. Примечательно и то, что бета-спираль в Вашей модели тоже является спиралью, а не плоским "тяжем", как считалось в старых учебниках молекулярной биологии. Теперь все желающие могут изучать молекулярную биология в т.ч. по новому учебнику "Пикотехнология белков", тем более, что уважаемый рецензент однозначно написал: "более чем полный массивный объем информации, увлекательная и яркая форма ее изложения и оформления делает монографию применимой также и в качестве учебника для студентов естественнонаучных специальностей, особенно таких, как биохимия, биофизика и биотехнология."
***
Полностью рецензии к книге "Пикотехнология белков" можно прочесть здесь: http://nanoworld.org.ru/topic/1150/

Иллюстрации, созданные в процессе дискуссии Соколик-Кушелев:

https://img-fotki.yandex.ru/get/17859/158289418.4b9/0_18a24c_59b08874_XL.gif

https://img-fotki.yandex.ru/get/4102/158289418.4b9/0_18a24d_d70cc4c_XL.png

https://img-fotki.yandex.ru/get/4102/158289418.4b9/0_18a24e_a6ecf0e1_XL.png

https://img-fotki.yandex.ru/get/28001/158289418.4b9/0_18a24f_d2627c15_XL.png
Оси вращения для текущего и предыдущего аминокислотных остатков показаны белыми линиями слева и справа соответственно.

https://img-fotki.yandex.ru/get/4102/158289418.4b9/0_18a250_3c0b8fa9_XL.png

Кушелев: Ось вращения аминокислот в модели Кушелева показана белым цветом (слева).
Ось вращения аминокислот в модели Соколик показана желтым цветом.
Ось вращения следующего аминокислотного остатка показана белым цветом (справа) и одинакова в моделях Соколик и Кушелева.

Кушелев: Обратите внимание на цвет колец. Цветом обозначены магнитные полюса электронов, обращенные от ядра атома наружу. В модели Кушелева следующий аминокислотный остаток присоединен таким образом, что чередование магнитных полюсов одинаково для всех аминокислотных остатков, т.е. белок собирается из одинаковых магнитных изомеров.

В модели Соколик четные аминокислотные остатки являются противоположными магнитными изомерами по отношению к нечетным. В них электронная "шкура" молекулы как бы вывернута наизнанку.

Если это не учитывать, то будет нарушен принцип чередования магнитных полюсов электронов, что соответствует правилу Хюккеля для сопряженных химических соединений. Конечно, любой электрон в 8-электронной оболочке можно перевернуть. При этом энергия связи из-за магнитного отталкивания одноименных полюсов изменится на доли процента, но этого достаточно, чтобы магнитный изомер был нестабильным. Поэтому все аминокислоты являются не только L-изомерами, но и одинаковыми магнитными изомерами. Это особенно важно для работы рибосомы, которая держит аминокислоты пятью вандерваальсовыми "присосками", которые одновременно являются и водородными связями. Эти магнитно-водородные "присоски" не будут удерживать магнитный изомер аминокислоты с той же силой, если магнитное притяжение в них сменить на магнитное отталкивание. Однако, Виктория Соколик отвергает факт вращения тРНК, модель которого вы видите ниже:

http://nanoworld88.narod.ru/data/247_files/0_51263_ece58a32_orig.gif

Она считает, что аминокислота удерживается ACC-концом тРНК так, как об этом написано в современных учебниках. Кстати, давайте прочитаем ...

https://img-fotki.yandex.ru/get/3800/158289418.4b9/0_18a252_51911a8c_XL.jpg

В современных учебниках написано и нарисовано, что аминокислота удерживается ССА-концом тРНК через единственную ковалентную или водородную связь. При этом ни о каких разных углах речи не идёт. В старых учебниках считается, что все аминокислоты присоединяются к предыдущим под одним углом, образуя линейную цепочку, которая после выхода из канала рибосомы сама чудесным образом решает, в какую вторичную структуру ей свернуться, в альфа-спираль, в 310-спираль, в пи-спираль или в бета-тяж. Ну или вообще не сворачиваться.

Модель механизма трансляции я опубликовал в рассылке "Новости лаборатории Наномир": http://nanoworld88.narod.ru/data/272.htm

http://nanoworld88.narod.ru/data/240_files/0_4f985_f662331c_orig.gif
Механизм декодирования угла поворота аминокислоты.

http://nanoworld88.narod.ru/data/227_files/0_4829f_ebf358c0_XL.png
Подробнее: http://nanoworld88.narod.ru/data/227.htm

В дискуссии Соколик-Кушелев мы обсудили и модель метионина Met:

http://nanoworld88.narod.ru/data/279_files/0_b3369_fa7106c0_M.gif

919

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 93

Формы, механизмы, энергия наномира. Сообщение 93 919

Определим структуры всех белков человека к Новому, 2018-ому году?

Число разновидностей белков человека около 5 000 000.

За всю историю развития науки и техники определено около 100 000 белковых структур (половина неправильно). На это истрачено более миллиарда USD.

https://img-fotki.yandex.ru/get/198860/158289418.3e0/0_176329_6d9df850_L.gif
Пример пикотехнологической 3D-модели белка.

Кушелев: На данный момент база белковых структур "Human Genome Protein", расположенная по этим адресам:

Part 1: https://cloud.mail.ru/public/BJeH/PdR6tFSsR

Part 2: https://cloud.mail.ru/public/Jxkq/Yt3GQAcC8

содержит структуры белков, закодированных

1(1812 структур из 11 046), 5, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23(X), 24(Y)-хромосомами человека:
https://img-fotki.yandex.ru/get/894414/158289418.4b5/0_189a97_82a0444c_orig.png

Примеры вторичных структур белка в компактном и развёрнутом виде:

https://img-fotki.yandex.ru/get/897810/158289418.4b6/0_189e73_8f3b4a12_orig.png

Развернуто:

https://img-fotki.yandex.ru/get/893753/158289418.4b7/0_18a055_f5f116d2_XL.png

***

https://img-fotki.yandex.ru/get/516365/158289418.4b7/0_189ecf_13af3e92_orig.png

https://img-fotki.yandex.ru/get/879536/158289418.4b7/0_189f2f_d2a84234_XL.png

https://img-fotki.yandex.ru/get/877700/158289418.4b7/0_18a065_70b30230_orig.png

https://img-fotki.yandex.ru/get/914553/158289418.4b7/0_18a069_6ec5aef6_orig.png






https://img-fotki.yandex.ru/get/876984/158289418.4b7/0_18a06c_288cc96f_orig.png

https://img-fotki.yandex.ru/get/874316/158289418.4b8/0_18a070_5b715cbf_orig.png

https://img-fotki.yandex.ru/get/875526/158289418.4b8/0_18a072_8eef4d58_orig.png

Укрупнение:

https://img-fotki.yandex.ru/get/874316/158289418.4b8/0_18a073_e57bd51_orig.png

https://img-fotki.yandex.ru/get/897810/158289418.4b8/0_18a0ba_e3f74559_orig.png

https://img-fotki.yandex.ru/get/896349/158289418.4b9/0_18a0fd_f166188_orig.png

920

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 93

Skype:

[23.12.2017 16:35:35] Инвестор С: Привет!
[23.12.2017 16:35:42] Инвестор С: только добрался до скайпа
[23.12.2017 16:35:56] Инвестор С: мне кажется вся эта затея утопия с модулятором за 0.5 ляма
[23.12.2017 16:37:17] Инвестор С: Саш тут прорабатываю одну идею - влезть в инновпарк.. при поддержке
[23.12.2017 16:38:05] Инвестор С: какие направления перспективные ты бы мог представить - БЕЗ сильного наезда на офнауку?)
[23.12.2017 16:38:07] Инвестор С: прорывные
[23.12.2017 19:02:56] Кушелев Александр Юрьевич: Прорывные и "без наезда на офф-науку" это как? smile
[23.12.2017 19:03:37] Кушелев Александр Юрьевич: Модулятор уже предоставляют на Заводе-2. На модулятор уже денег не надо.
[14:02:40] Инвестор С: Это то что можно представить для того что бы профинансировать а оф наука не завопила сразу))
[14:02:53] Инвестор С: расчет структуры белка я так понимаю?
[14:39:37] Кушелев Александр Юрьевич: Завопит по-любому на всё новое. Ведь офф-наука это бюджетопилка. Любая угроза для бюджетопилки аукнется агрессией.
[14:41:24] Кушелев Александр Юрьевич: Если прийти в академию наук со стороны, то просто не будут слушать или послушают, как меня, но никаких бумаг не дадут. Я же докладывал в МГУ. И по пикотехнологии, и по Emdrive. Никаких документов не дали. Просто послушали, чтобы что-нибудь украсть.
[14:42:26] Кушелев Александр Юрьевич: А все научные конференции - это сбор денег с докладчиков или их организаций.
[14:43:56] Кушелев Александр Юрьевич: Государственное финансирование - это бюджетопилка однозначно. Там никого с улицы не пустят. Если только в качестве будущего козла отпущения. Меня тоже приглашали "на откат"
[14:45:16] Кушелев Александр Юрьевич: Прямо так и сказали: Мы тебе выбьем 10 миллионов, 9 нам. Понятно, что после этого будет проверка и меня посадят.