331

Re: Пикотехнология белков, ДНК, РНК - 3

Заказ: 20170909_046:

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/1102696000

>ENA|OIV95494.1
atgaggatgaggaggaggaggaggaggaggaggatgaggataggattggatgacgatgag
gacgaggatgaggatgaggaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaa
gaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggaagaggatgaggatgaggataggatg
aggacgaggataggatga

Результат:

https://img-fotki.yandex.ru/get/226123/158289418.475/0_181ade_564198ef_orig.png

Развернуто:

https://img-fotki.yandex.ru/get/478662/158289418.475/0_181adf_bc3a89a5_XL.png
Оригинал: https://img-fotki.yandex.ru/get/478662/ … 5_orig.png

1373 аминокислотных остатка Glu (на концах спирали по 2-3 Asp) образуют 35-спираль (пикотехнологический реактор сверхвысокого давления).

332

Re: Пикотехнология белков, ДНК, РНК - 3

Online service PROTEIN PICOTECHNOLOGY

Заказ: 20170909_047:

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/943392557

>ENA|KXJ25885.1
atgactgagactcggacgttggccaccagttttttactgcttagtattgtatacattgca
gggttttatattctggaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaag

Результат:

https://img-fotki.yandex.ru/get/516365/158289418.475/0_181ae0_dbec6842_XL.png

Прямая пи-спираль состоит из 1938 аминокислотных остатков Glu

333

Re: Пикотехнология белков, ДНК, РНК - 3

Заказ: 20170910_017:

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/XM … port=fasta

>ENA|XM_003716524.1 Magnaporthe oryzae 70-15 hypothetical protein partial mRNA
ATGTCGCGCTGTGACAACAGCCCCATAATAATAATAATAATAGTAATAATAATAATAATAATAATAATAA
TAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAT
AATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATA
ATAATAATAATAATAATTTTAGAAAGGACCTTGACGACGATATCTTCCTTTCAAGTTGAGTGGCGGAAGC
ACTTGGTACTGATGACTTGA

Результат:

https://img-fotki.yandex.ru/get/509531/158289418.476/0_181b5f_e8a634ca_XL.png

Развернуто:

https://img-fotki.yandex.ru/get/245409/158289418.476/0_181b5e_2bc4a1e9_XL.png
Оригинал: https://img-fotki.yandex.ru/get/245409/ … 9_orig.png

https://img-fotki.yandex.ru/get/765779/158289418.476/0_181b60_ce318d04_orig.png

Бета-спираль длиной 67 аминокислотных остатков Ile

334

Re: Пикотехнология белков, ДНК, РНК - 3

Заказ: 20170910_025:

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/XM … port=fasta

>ENA|XM_016303689.1 PREDICTED: Ficedula albicollis basic proline-rich protein-like (LOC107604154), partial mRNA
ATGCTGGGGGACCCCCGGCCCGTGCAGCTCCCCGCTGCCAGGGGCACTCTGAGCACCCAGCCCCCCCCCC
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
CCCCCCCCCCCCCCCCC

Результат:

https://img-fotki.yandex.ru/get/509885/158289418.477/0_181b88_bac5d01_XL.png

Развернуто:

https://img-fotki.yandex.ru/get/516998/158289418.477/0_181b87_e300c32d_XL.png
Оригинал: https://img-fotki.yandex.ru/get/516998/ … d_orig.png

Прямая преимущественно полипролиновая спираль насчитывает 503 аминокислотных остатка

335

Re: Пикотехнология белков, ДНК, РНК - 3

Формы, механизмы, энергия наномира. Сообщение 90 245

Открываем экзотические структуры белков

Рекорды сверхдлинных спиралей белковых молекул

Online service PROTEIN PICOTECHNOLOGY

Заказ: 20170911_016:

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/1129188588

>ENA|OLP94260.1 fragment
atgtcgcagggtcagagctaccagaagggcgtcgggcttatgtcgcagggtcagagctac
cagaagggcgtcgggcttatgtcgcagggtcagagctaccagaagggcgtcgggcttatg
tcgcagggtcagagctaccagaagggcgtcgggcttatgtcgcagggtcagagctaccag
aagggcgtcgggcttatgtcgcagggtcagagctaccagaagggcgtcgggcttatgtcg
cagggtcagagctaccagaagggcgtcgggcttatgtcgcagggtcagagctaccagaag
ggcgtcgggcttatgtcgcagggtcagagctaccagaagggcgtcgggcttatgtcgcag
ggtcagagctaccagaagggcgtcgggcttatgtcgcagggtcagagctaccagaagggc
gtcgggcttatgtcgcagggtcagagctaccagaagggcgtcgggcttatgtcgcagggt
cagagctaccagaagggcgtcgggcttatgtcgcagggtcagagctaccagaagggcgtc
gggcttatgtcgcagggtcagagctaccagaagggcgtcgggcttatgtcgcagggtcag
agctaccagaagggcgtcgggcttatgtcgcagggtcagagctaccagaagggcgtcggg
cttatgtcgcagggtcagagctaccagaagggcgtcgggcttatgtcgcagggtcagagc
taccagaagggcgtcgggcttatgtcgcagggtcagagctaccagaagggcgtcgggctt
atgtcgcagggtcagagctaccagaagggcgtcgggcttatgtcgcagggtcagagctac
cagaagggcgtcgggcttatgtcgcagggtcagagctaccagaagggcgtcgggcttatg
tcgcagggtcagagctaccagaagggcgtcgggcttatgtcgcagggtcagagctaccag
aagggcgtcgggcttatgtcgcagggtcagagctaccagaagggcgtcgggcttatgtcg
cagggtcagagctaccagaagggcgtcgggcttatgtcgcagggtcagagctaccagaag
ggcgtcgggcttatgtcgcagggtcagagctaccagaagggcgtcgggcttatgtcgcag
ggtcagagctaccagaagggcgtcgggcttatgtcgcagggtcagagctaccagaagggc
gtcgggcttatgtcgcagggtcagagctaccagaagggcgtcgggcttatgtcgcagggt
cagagctaccagaagggcgtcgggcttatgtcgcagggtcagagctaccagaagggcgtc
gggcttatgtcgcagggtcagagctaccagaagggcgtcgggcttatgtcgcagggtcag
agctaccagaagggcgtcgggcttatgtcgcagggtcagagctaccagaagggcgtcggg
cttatgtcgcagggtcagagctaccagaagggcgtcgggcttatgtcgcagggtcagagc
taccagaagggcgtcgggcttatgtcgcagggtcagagctaccagaagggcgtcgggctt
atgtcgcagggtcagagctaccagaagggcgtcgggcttatgtcgcagggtcagagctac
cagaagggcgtcgggcttatgtcgcagggtcagagctaccagaagggcgtcgggcttatg
tcgcagggtcagagctaccagaagggcgtcgggcttatgtcgcagggtcagagctaccag
aagggcgtcgggcttatgtcgcagggtcagagctaccagaagggcgtcgggcttatgtcg
cagggtcagagctaccagaagggcgtcgggcttatgtcgcagggtcagagctaccagaag
ggcgtcgggcttatgtcgcagggtcagagctaccagaagggcgtcgggcttatgtcgcag
ggtcagagctaccagaagggcgtcgggcttatgtcgcagggtcagagctaccagaagggc
gtcgggcttatgtcgcagggtcagagctacctgaagggcaacgaaggcatccaggttttg
tcaatggcacagatcgggaagggtcctttgctttgcctcgtagacaagaacgacgcaggt
cctggtcccaaggccgtgatgttgatcctcagggcgcccgtgaaggtgatgatggtcagc
ag

Результат:

https://img-fotki.yandex.ru/get/467315/158289418.478/0_1824ad_e6219f8f_XL.png

Развернуто:

https://img-fotki.yandex.ru/get/762837/158289418.478/0_1824ac_b9a1378a_XL.png
Оригинал: https://img-fotki.yandex.ru/get/762837/ … a_orig.png

Фрагмент:

https://img-fotki.yandex.ru/get/762837/158289418.478/0_1824ae_e54e857a_orig.png

Программная 5553111111143-спираль, образованная последовательностью аминокислотных остатков (MSQGQSYQKGVGL)*n.
Длина программной спирали 670 аминокислотных остатков. Собирается под музыку с размером 13/8. Очень интересно увидеть пространственную модель...

https://img-fotki.yandex.ru/get/508985/158289418.478/0_1824f5_90a30e27_XL.png
Обратите внимание на взаимодействия радикалов Met и Tyr

https://img-fotki.yandex.ru/get/483127/158289418.478/0_1824f6_1f927801_XL.png

https://img-fotki.yandex.ru/get/233740/158289418.478/0_1824f7_8643ad22_XL.png

https://img-fotki.yandex.ru/get/245409/158289418.478/0_1824f8_20d9a226_XL.png

https://img-fotki.yandex.ru/get/372429/158289418.478/0_1824f9_dd46fc77_XL.png
Программная спираль имеет ось симметрии ~5-го порядка

https://img-fotki.yandex.ru/get/237726/158289418.478/0_1824fa_f519f947_XL.png
Очевидно взаимодействие радикалов Met66-Tyr72 и Gln57-Lys61

https://img-fotki.yandex.ru/get/246987/158289418.478/0_1824fb_627490b0_orig.gif

336

Re: Пикотехнология белков, ДНК, РНК - 3

Формы, механизмы, энергия наномира. Сообщение 90 317

Пикотехнология белков, ДНК, РНК - 3

Что такое программа "Пикотехнология белков", и как её грамотно использовать

Online service PROTEIN PICOTECHNOLOGY

Кушелев: Пикотехнология была создана в 1988-ом году и продемонстрирована на ВДНХ СССР в 1989-ом. Отмечена премией ВДНХ СССР.

http://www.nanoworld.org.ru/data/01/data/images/people/kushelev/n-publ00.jpg

http://www.nanoworld.org.ru/data/01/data/images/people/kushelev/n-publ01.jpg

Подробнее: http://www.nanoworld.org.ru/data/01/dat … 010511.htm

Первая 2D версия программы Пикотех была написана в 1992-ом году: http://www.nanoworld.org.ru/data/01/dat … ne_str.exe

Первая 3D версия программы Пикотех была написана в 1995-ом году: http://www.nanoworld.org.ru/data/01/dat … ne2ent.zip

В настоящее время используется 3D версия-script для 3DS Max, написанная в 2004-ом и настроенная в 2010-ом году: http://www.nanoworld.org.ru/data/200402 … /index.htm

В ней не учитываются физико-химические взаимодействия.

Современная 2D версия написана в 2017-ом году. В этом же году написана геномная версия, которая позволяет обрабатывать весь геном.

От 1989-го (идея) до 2017-го (геномная версия 2D Пикотех) прошло 2017-1989=28 лет. Ещё пару лет, и пикотехнологией начнут пользоваться во всех лабораториях, изучающих структуры белка.

А пока у Вас есть возможность "пробежаться впереди паровоза" и бесплатно узнать структуры белков, за что сегодня по старой технологии платят по 10 000 евро за структуру.

Онлайн-сервис Protein Picotech: http://nanoworld.org.ru/topic/1699/

https://img-fotki.yandex.ru/get/467315/158289418.478/0_1824ad_e6219f8f_XL.png

https://img-fotki.yandex.ru/get/246987/158289418.479/0_1824fc_837465ad_orig.gif

https://img-fotki.yandex.ru/get/369579/158289418.475/0_181ad9_2c387c00_orig.png

https://img-fotki.yandex.ru/get/198860/158289418.3e0/0_176329_6d9df850_L.gif

337

Re: Пикотехнология белков, ДНК, РНК - 3

Кушелев: Кто-то давно исследует белки с периодичной последовательностью аминокислотных остатков: https://books.google.ru/books?id=vCYBDg … mp;f=false

https://img-fotki.yandex.ru/get/874801/158289418.493/0_1852c3_66166b38_orig.jpg

Кушелев: Надо бы связаться с авторами таких исследований и показать им программные спирали белков. Я думаю, что они оценят этот научный прорыв в первую очередь.

338

Re: Пикотехнология белков, ДНК, РНК - 3

Формы, механизмы, энергия наномира. Сообщение 92 685

Пикотехнология белков, ДНК, РНК - 3

Рекорды сверхдлинных спиралей белковых молекул

Программная аллотропия белков опровергает гипотезу фолдинга

Victoriy пишет:

фолдинг этих самых структурных шаблонов в энергетически устойчивую функциональную конформацию

Кушелев: Уважаемая Виктория! Как Вы прокомментируете открытие программных спиралей белковых молекул?

https://img-fotki.yandex.ru/get/509292/158289418.4a7/0_186c5c_1ebe5075_XL.png
Здесь Вы видите 19 вторичных структур поливалина. На схеме вторичной структуры представлены фундаментальные спирали:
альфа-, 310-, пи-, бета-
и программные:
14-, 35-, 352-, 144-, 25-, 22225-, 411412-, 255-, 2444-, 1144-, 11444444-, 23-, 335(коллагеновая)-

Помните, как мы с Вами дискутировали по поводу лизиновых "хвостов", т.е. участков пи-спиралей длиной более 10 аминокислотных остатков? Вы ещё писали, что это всё гипотетические структуры...

А как Вы прокомментируете тему: "Рекорды сверхдлинных спиралей белковых молекул"?

Там встречаются фундаментальные спирали (альфа-, 310-, пи-, бета-) длиной более 3000 аминокислотных остатков. И программные спирали, в т.ч. фрактальные более 100 периодов, например, по 35 аминокислотных остатков в периоде, т.е. более 3500 аминокислотных остатков в спирали.

Если бы была верна гипотеза фолдинга, то зачем было бы кодировать все эти спиральные структуры?

Антигомология = программная аллотропия опровергает гипотезу фолдинга. Согласны?

339

Re: Пикотехнология белков, ДНК, РНК - 3

Формы, механизмы, энергия наномира. Сообщение 92 735

Пикотехнология белков, ДНК, РНК - 3

Victoriy пишет:

в конформации белка закодированные спиральные участки не выстраиваются нескончаемой трубой друг за другом, а благодаря межмолекулярным взаимодействиям контактируют друг с другом, образуя энергетически равновесную, устойчивую конформацию с гидрофобным ядром. При этом, если отдельные закодированные спиральные участки в белке не получают дополнительной фиксации со стороны ближнего окружения атомов в радикалах аминокислот или остаются экспонированы в гидрофильную среду, то они как правило разворачиваются под действием молекул воды и образуют уже не свернутые или петлевые области в структуре белка. Вышеописанный процесс носит название ФОЛДИНГ белка.

Кушелев: Уважаемая и гениальная Виктория!

Вы можете прокомментировать эти две структуры полилизина?

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/XM … port=fasta

https://img-fotki.yandex.ru/get/872977/158289418.4a8/0_186f28_9609f17b_XL.png

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/700454480

https://img-fotki.yandex.ru/get/878955/158289418.4a8/0_186f2a_83132c7f_XL.png

Развёрнуто:

https://img-fotki.yandex.ru/get/892397/158289418.4a9/0_186f36_d8ccd8b5_orig.png
https://img-fotki.yandex.ru/get/892397/ … 5_orig.png
Я продублирую эту схему по скайпу, чтобы Вы смогли посмотреть в любом браузере...

Кстати, какую структуру (или структурный шаблон, как Вы это называете) показывает Ваш алгоритм для этих двух белков?

Пи-спирали в белках бывают и длиннее:

Kushelev пишет:

Online service PROTEIN PICOTECHNOLOGY

Заказ: 20170909_047:

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/943392557

>ENA|KXJ25885.1
atgactgagactcggacgttggccaccagttttttactgcttagtattgtatacattgca
gggttttatattctggaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaagaa
gaagaagaag

Результат:

https://img-fotki.yandex.ru/get/516365/158289418.475/0_181ae0_dbec6842_XL.png

Прямая пи-спираль состоит из 1938 аминокислотных остатков Glu

310-спирали тоже:

Заказ 2017-10-31_20

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/11 … mask=65536

>OLQ12821
atgtgcgatccagtgtacacgttgggcgtcgtgggtattctggacagcgagtatcttcca
gcatctatctacacggggaagtggtggtggttgttggtggtggtggtggtgctgctgctg
ctgctgctgctgctgctggtgctggtggtggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtggtggtggtggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctg
gtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtgctggtggggtgcgaagcgcactggcag
ttgatcggacaccttttacaccgcaacatgcaaaagtga

Результат:

https://img-fotki.yandex.ru/get/894414/158289418.496/0_18595b_35660302_orig.png

Развернуто:

https://img-fotki.yandex.ru/get/478910/158289418.496/0_18595d_a88996b4_orig.png

Последовательность n(VL) образует 310-спираль длиной 3982 аминокислотных остатка.

И что-то Вы никак не комментируете программные спирали белков:

http://nanoworld.org.ru/topic/1656/page/11

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/1129202102

Фрагмент:

https://img-fotki.yandex.ru/get/368754/158289418.4a4/0_18639b_1f4a4304_orig.png

Что для этого белка показывает Ваш алгоритм?

И как быть с такими структурами?

http://nanoworld.org.ru/topic/1699/page/66/

https://img-fotki.yandex.ru/get/368754/158289418.4a8/0_186cc6_95a06491_orig.png
На всякий случай я эту структуру тоже продублирую для Вас по скайпу.

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/LS … mask=65536

Какую вторичную структуру для этого белка показывает Ваш алгоритм? Может быть такую же, как и мой? smile

340

Re: Пикотехнология белков, ДНК, РНК - 3

Victoriy пишет:

Беру белок OLQ12821.1 и выясняю, что это hypothetical protein AK812_SmicGene3237 [Symbiodinium microadriaticum], т.е. Вы моделируете структуру ГИПОТЕТИЧЕСКОГО белка дрожжей.

Кушелев: Да Бог с ним, с этим гипотетическим белком.

Что с этим белком делать?

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/XM … port=fasta

PREDICTED: Astyanax mexicanus protein FAM133-like (LOC111193520), partial mRNA
NCBI Reference Sequence: XM_022674627.1
GenBank Graphics
>XM_022674627.1 PREDICTED: Astyanax mexicanus protein FAM133-like (LOC111193520), partial mRNA
GTCCAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

Кушелев: Моя программа показывает пи-спираль. А Ваша?