71

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 88

diprospan пишет:

все те белки которые были кому нужны уже давно определены и выложены
в свободном доступе для всех желающих на общедоступных ресурсах протеинов.

Кушелев: Ну надо же, а кто-то ежедневно оплачивает десятки новых структур в среднем по 10 000 евро. И эти структуры появляются в базе данных PDB.

Вы им скажите, что "зря выбрасываете деньги на ветер" wink

72

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 88

diprospan пишет:

связь строения белковых молекул с их функциями ещё никем пока не обнаружена

Кушелев: Каждое Ваше утверждение надо прямо золотыми буквами отливать wink

Механизмы многих белков в общих чертах уже известны, но пикотехнология даёт возможность разобраться в деталях...

http://img-fotki.yandex.ru/get/5506/126580004.42/0_b37ab_6493b0b7_S.gif http://img-fotki.yandex.ru/get/9116/158289418.af/0_ae267_2d0606e3_orig.gif
Подробнее: http://nanoworld.org.ru/topic/1699/

73

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 88

Кушелев:
Ну надо же, а кто-то ежедневно оплачивает десятки новых структур в среднем
по 10 000 евро. И эти структуры появляются в базе данных PDB.

ссылок то нет на такие купли и продажи.
значит - миф.
иначе этот рынок был бы известен и окучен.
кто-то пошутил давно в субботу, а люди повторяют.
структуры появляются в PDB примерно как стихи появляются на ресурсе стихи-ру:
https://www.stihi.ru
""из какого сора растут стихи не ведая стыда..."

74

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 88

Формы, механизмы, энергия наномира. Сообщение 88 074

Средняя цена определения одной структуры белка ~10 000 USD

diprospan пишет:

ссылок то нет на такие купли и продажи.
значит - миф.

Кушелев: А зачем Вам ссылки? Изучите прайс на определение структуры белка в лаборатории РСА, "и будет Вам счастье" smile

А следить за числом структур в PDB можно на сайте PDB. Там ежедневно появляется около 50 новых структур, за которых кто-то заплатил в среднем 10 000 евро.

Кстати, материал с ценами белковых структур недавно проходил на форуме лаборатории Наномир. Вы, вероятно, не следите за темой...

http://www.reitingi.lv/ru/news/sabiedribap/15235.htm

Лаборантка уничтожила белковые кристаллы стоимостью полмиллиона долларов

https://img-fotki.yandex.ru/get/3214/158289418.424/0_17ad16_4f161f18_orig.jpg

Бывшая сотрудница Национальной ускорительной лаборатории SLAC из-за депрессии уничтожила белковые кристаллы стоимостью полмиллиона долларов. О преступлении, которое может сильно затормозить приоритетный научный проект, пишет газета San Jose Mercury News. Злоумышленница была арестована.
Сильвия Оомахен (Silvya Oommachen), работавшая лаборанткой, прошла мимо охраны в помещение, где при низких температурах хранились белковые кристаллы. Она достала из морозильной камеры 42 плашки, в каждой из которых хранилось по 96 образцов белков, и оставила их на столе при комнатной температуре. Пребывание в тепле в течение длительного времени привело к разрушению кристаллов.

Оомахен оставила в комнате три записки. На одной она написала один из своих сетевых псевдонимов, на другой - ругательство, а на третьей - дату, когда она вынула белки из холодильника. По словам самой Оомахен, она сделала это, чтобы сбить с толку полицию.

Причиной поступка лаборантки стали неурядицы в личной жизни и на работе. По словам коллег, у Оомахен были очень плохие отношения с ее начальником. В июне женщина перестала ходить на работу, после чего ее уволили. Полицейские полагают, что Оомахен разрушила образцы, "чтобы немного исправить свою плохую карму".

На восстановление кристаллов у сотрудников лаборатории уйдет несколько недель. Выращивание белковых кристаллов - весьма трудоемкий процесс, требующий тщательного подбора условий. Уничтоженные образцы были получены в рамках проекта Protein Structure Initiative, цель которого - найти менее трудоемкие и более эффективные способы выращивания белковых кристаллов. Кристаллы необходимы ученым для того, чтобы определять трехмерную структуру белков.

Преступление Оомахен вызвало дискуссии о требованиях безопасности в научных учреждениях. Их чрезмерное ужесточение мешает нормальной работе. Однако произошедший случай показал, как легко один человек может причинить огромный ущерб научному проекту.

***
Кушелев: 42 плашки, в каждой из которых хранилось по 96 образцов. Это стоит 500 000 долл. Вот и считайте, сколько стоит один образец.

Для определения структуры белка выращивают плашку (96 образцов). Одна плашка стоит  500 000 / 46 = 10 869 USD

75

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 88

Кушелев:
А зачем Вам ссылки? Изучите прайс на определение структуры белка в лаборатории РСА, "и будет Вам счастье"

многие пробовали найти, но увы, в top-20 выпадают только Ваши ссылки на ничто.
ссылки могли бы быть любопытны не для счастья, просто для смысла постящего,
Вы же напостили, ссылки вышли в топ, в гугле выпадают в top-20, а смысла то нет,
о чьём счастье то речь, да появляются 50 новых структур, бесплатно, как 50 новых
стихов появляется на стихи-ру.
https://www.stihi.ru
на нет и суда нет, хозяин - барин, нет расценок, есть только буквы вокруг мифов.
да ещё из прибалтийской жёлтой прессы, я про структуры, там про кристаллы.
в огороде бузина а в киеве дядька.

76

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 88

diprospan пишет:

появляются 50 новых структур, бесплатно

Кушелев: Вы глаза-то откройте: http://www.reitingi.lv/ru/news/sabiedribap/15235.htm

46 белковых структур обошлись заказчикам в пол миллиона USD.

Перепроверьте, если глазам своим не верите smile

https://img-fotki.yandex.ru/get/3214/158289418.424/0_17ad16_4f161f18_orig.jpg

77

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 88

diprospan пишет:

я про структуры, там про кристаллы.
в огороде бузина а в киеве дядька.

А... Вы даже не в курсе, что РСА может работать только с кристаллами белков, а кристаллизуется только 3% белков?

За остальные 97% заказчики готовы заплатить больше, чем по 10 000 евро. Не знали? wink

78

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 88

если бы были ссылки на экономистов или финансистов, которые бы подтвердили,
что дескать таки да, существует в природе такой рынок, и что там есть как спрос,
так и предложение, и рынок этот оценивается в N попугаев, тогда можно было бы
слегка об этом и подумать.
а то получается что к мифу из газеты применили действие школьной математики,
и получили некую гипотезу не тянущую на предположение даже.
с грамотными людьми проще, они в классификаторе глянули - нет такого бизнеса.

79

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 88

да и арифметика иная
42*96=4032
500000/4032=124
124 это меньше чем 10000

80

Re: Формы, механизмы, энергия наномира - 88

diprospan пишет:

если бы были ссылки на экономистов или финансистов, которые бы подтвердили,
что дескать таки да, существует в природе такой рынок, и что там есть как спрос,
так и предложение, и рынок этот оценивается в N попугаев, тогда можно было бы
слегка об этом и подумать.

А что Вам мешает найти такие ссылки? И что мешает поинтересоваться ценами в лабораториях РСА? Просто позвоните в институт белка и спросите, правда ли, что за каждую структуру белка приходится платить в среднем 10 000 евро? А ответ опубликуйте на форуме. Я-то этот ответ Вам уже дал. Но Вы можете перепроверить smile

diprospan пишет:

к мифу из газеты применили действие школьной математики,
и получили некую гипотезу не тянущую на предположение даже.
с грамотными людьми проще, они в классификаторе глянули - нет такого бизнеса.

Кушелев: "Грамотеев" нынче "пруд пруди", да только толку от Ваших "грамотеев" "ноль целых, ноль десятых" smile

Попросите своих "грамотеев" определить структуру белка с помощью стандартных методов. И посмотрите, чего стоят Ваши "грамотеи" wink