101

Re: Общество вимановладельцев

Поиск по терминам диссертации Толстовой Анны Павловны

https://xpir.ru/dossier/project/corebof … lj9c9thegs

https://www.google.ru/webhp?sourceid=ch … 1%82%D1%8C

Диссертации удобны тем, что в них указывается актуальность исследований и направлений.
Думаю, найти упоминание белков, которые в их работах изучаются, и собирать названия.

102

Re: Общество вимановладельцев

Соколова Ольга Сергеевна автореферат докторская диссертация http://www.bio.msu.ru/res/Dissertation/ … kolova.pdf

103

Re: Общество вимановладельцев

Татьяна Рясина пишет:

ФЛН

Если можно не сокращайте такие названия, как "Форум лаборатории Наномир" и "Лаборатория Наномир".

Я сам с трудом догадался, а новички будут спрашивать и переспрашивать..

104

Re: Общество вимановладельцев

О.С.Соколова,  автореферат на степень  д.б.н. стр. 32-33.

Кристаллические структуры некоторых I-BAR доменов были опубликованы (Millard et al 2005, .....,) однако механизм связывания I-BAR домена с мемебраной до сих пор не известен.
Структура Millard et al 2005 находится
http://www.rcsb.org/pdb/explore/explore … ureId=1Y2O

Для изучения I-BAR домена белка IRSp53 ....
Если набрать IRSp53
http://www.rcsb.org/pdb/results/results … d=840351E9
Достаточно много данных находится

Т.е. доктором Соколовой вероятно есть что обсудить, как вариант - Пикотех модели белков из её диссертации, это может её заинтересовать.

В своей работе она ставить определённые проблемы  задачи.  Если можно найти там специфические задачки, которые решаются с помощью Пикотеха, ей будет ещё интереснее.

По диссертациям можно найти потенциальных адресатов для выхода на контакт. Т.е. есть над чем помедитировать.

Я так поняла, что мембранные белки часто и много изучаются. Мне кажется, Пикотех может помочь получить на вопросы в этой области. 

Здесь встаёт вопрос о грантах и прочих финансах. По моему наблюдению, чем выше положение профессора на Западе, тем больший % своего времени он пишет гранты и ставит задачи для тех кто под его руководством (по общению с одногруппниками). 

Вот у меня ещё вопрос возник - как Пикотех может помочь моделировать взаимодействия в клетках или тсруктурах меньшего масштаба - молекул с молекулами и пр. и пр. ?

Тогда примерная схема обращения такая
Здравствуйте, предлагаем попробовать в Ваших исследованиях наш Метод Пикотех. В Вашей диссертации описано Ваше исследование (......)  . Вот такие вопросы можно разрешить, сделав структуры (....) и (....)  и спрогнозировать (....)  Ну примерно так.  А что в скобочках писать - нужно угадать, понять или придумать )))))

105

Re: Общество вимановладельцев

Kushelev пишет:
Татьяна Рясина пишет:

ФЛН

Если можно не сокращайте такие названия, как "Форум лаборатории Наномир" и "Лаборатория Наномир".

Я сам с трудом догадался, а новички будут спрашивать и переспрашивать..

Да, не буду сокращать ))))

106

Re: Общество вимановладельцев

То есть я просто пытаюсь сформулировать мысль, что не бесполезно делать белковые структуры Пикотех из чьих-то статей и диссертаций, а потом им высылать по электронной почте белки, которые авторов затрагивают непосредственно.  Можно даже СМС-ки на мобильные отправлять со ссылкой на пост форума и решением  структуры, это совсем уже явная буде рассылка. Некоторые мобильные авторов статей можно найти в сети.  Век информации, однако
Не сложно в принципе, а вероятность встретить динозавра постепенно повышается...

107

Re: Общество вимановладельцев

Татьяна Рясина пишет:

А что в скобочках писать - нужно угадать, понять или придумать )))))

Виктория Соколик: Уважаемые коллеги, Вашему вниманию предоставляется услуга -- моделирование 2D и 3D структуры любого белка без ограничений в его размере и степени изученности с помощью программного обеспечения, базирующемся на принципиально новом подходе декодирования нуклеотидной последовательности, детерминирующей данный белок.

Всё, что необходимо от заказчика, это нуклеотидная последовательность мРНК интересующего его белка (или код этой нуклеотидной последовательности в EMBL, или хотя бы код самого белка в PDB).

В течение 1-3 суток мы готовы предоставить Вам схему вторичной структуры заказанного белка (2D), модель его пространственной структуры (3D) в виртуальном пространстве, а также файл .pdb с координатами каждого атома белка.

Файл .pdb может быть использован по аналогии с файлами закристаллизованных белков из PDB банка для дальнейшего конформационного анализа белка методами молекулярной динамики с учётом физико-химической специфики микроокружения белка или его взаимодействия с лигандами.

Таким образом, Вы сможете максимально быстро удобным для Вас способом (по электронной почте, на сайте либо на электронном носителе) получить информацию о структурном шаблоне Вашего белка.

Определены две структуры белка (пробный заказ) для Испанского заказчика.

В книге "Пикотехнология белков" приведены примеры 100 белковых структур.

Подробнее: http://subscribe.ru/archive/science.new … 5325.html/

108

Re: Общество вимановладельцев

Спасибо больше Виктория и Александр Юрьевич!
Пикотех обрёл товарный вид благодаря новейшим зимним обновлениям
С учётом новогодних открытий доверстала продающие (как я думаю) странички
https://nano-world-articles.nethouse.ru … na-zakaz#/
и
https://picosoft.nethouse.ru/
Теперь протестирую как это будет рассылаться и читаться получателями.

109

Re: Общество вимановладельцев

ЗдОрово!

110

Re: Общество вимановладельцев

Письмо исследователям белковых структур и смежных направлений


Здравствуйте ..................!

Просим Вас ознакомиться с нашей разработкой Пикотех (Пикотехнология белков)  и составить Ваше мнение о её информативности и применимости для Ваших исследований.

Направьте нам код интересующего Вас белка  (кодирующая нуклеотидная последовательность, или код нуклеотидной последовательности в EMBL, или код белка в PDB ) и мы через несколько дней вышлем Вам его  виртуальную 2D  и 3D структуру, содержащую координаты всех атомов с точностью до пикометра, подробную детализацию всех белковых комплексов, точные значения углов поворота и указания типов всех участков спиралей.

Также по отдельному запросу мы выполним для Вас четвертичную структуру и прогноз свойств.

Вы можете разместить Ваш запрос на странице http://picosoft.nethouse.ru или отправить его на электронную почту  kushelev20120@yandex.ru и на Skype kushelev2009

С уважением,
Кушелев А.Ю.
Руководитель
Лаборатория Наномир
+7 (903) 2003424
+7 (916) 8265031
+7 (926) 5101703
E-mail kushelev20120@yandex.ru
Skype kushelev2009
Кушелев А.Ю.



Дополнительная часть, когда она окажется уместной -----------------

Также просим Вас рассмотреть предлагаемый нами дизайн экспериментов и по выделению сигнала остановки феноптоза (запрограммированной смерти) - для совместной разработки и реализации программы исследований на основе предлагаемой Вашему вниманию описательной части.



Ещё момент, как бы рационализаторский и организационный, обдумайте пожалуйста

Всем кто хочет продвигать Пикотех, я могу сделать точно такую же страницу как http://picosoft.nethouse.ru (точь в точь) - ну чистый клон  , только с их собственным названием сайта (типа picosoft1.nethouse.ru ,  picosoft2.nethouse.ru, каждому продюсеру свой)  и с  их собственной  электронной почтой на каждом сайте.  Чтобы их клиенты высылали свои заказы заказы на структуры белков прямо к ним в руки.