9920217 Механизм композиционного кодирования (науч)

аминокислотных остатков в белке.

Транспортная РНК может иметь первые основания антикодона.
I --- U, C или A
U --- A или G
G --- C или U
которые могут  образовывать  пары  с  третьим  основанием кодона
неоднозначно.

Гипотеза: Первое  основание  антикодона  преобразует  код в угол
поворота аминокислоты  при  помощи  скручивания  плеча  т-РНК  в
разной степени, которая зависит от вандерваальсового радиуса.

920206
A   Ala
C   Cys     
D   Asp     
E   Glu     
F   Phe    
G   Gly    
H   His       
I   Ile
K   Lys
L   Leu
M   Met
N   Asn
P   Pro
Q   Gln
R   Arg
S   Ser
T   Thr
V   Val
W   Trp
Y   Tyr

                          Инсулин.
 Gly  -  Ile  -  Val    -   Glu  -   Gln  -  Cys  -       
Альфа   Альфа   Альфа -   Кси Asp   Альфа   Бета             
 GGC     AUU     GUG        GAU      CAG     UGC             

 Cys      -      Ala         -        Ser        -      
Бета       Кси Альфа ? Thr      Тета Кси Альфа ?  
 UGC             ACC                  AGC                

     Val     -    Cys    -    Ser      -     Leu     -                                
Ile Кси Альфа ?   Бета   Лямбда Альфа - ?   Кси Лямбда                                                      
      AUC          UGC         UCC            CUC                         

 Tyr  -  Gln   -   Leu    -    Glu  -  Asn  -  Tyr  -                          
Альфа    Кси   Лямбда Альфа   Альфа    Кси    Альфа                           
 UAC     CAA       CUG         GAG     AAC     UAC                   

 Cys  -  Asn  -  Phe  -  Val   -  Asn   -  Gln  -  His  -                                
Бета     Кси     Кси    Альфа   Кси Lys   Альфа   Бета                                     
 UGC     AAC     UUU     GUC      AAA      CAG     CAC                            

     Leu     -    Cys  - Gly  - Pro  -  His       Leu    -                     
Лямбда Альфа -   Альфа   Кси   Альфа   Бета   Альфа Лямбда                                                      
     CUU          UGU    GGU    CCU     CAC       CUG                             
                                                                     
   Val   -   Glu   -   Ala     -    Leu    -    Tyr     -                                                                
Альфа - ?   Альфа   Альфа - ?   Альфа Лямбда   Альфа                                                                     
   GUG       GAG       GCU          CUG         UAC                                                                  
                                                                        
    Leu      -    Val    -   Cys    -   Gly   -  Glu   -                                                            
Альфа Лямбда   Альфа - ?   Альфа ?   Альфа - ?   Кси                                                                 
    CUG           GUG        UGU        GGG      GAA                                                                  

   Arg  -  Gly  - Phe   - Phe  -  Tyr    -   Phe    -                                                                     
Тета Кси   Кси   Альфа   Альфа   Альфа   Thr Альфа ??                                                                      
   CGU     GGU    UUC     UUC     UAC        ACA                                                         

  Pro   - Lys      -    Ala      -                                                          
Кси ??   Альфа   Ser Лямбда Альфа ??                                                                 
  CCC     AAG           UCC                                                           

Миоглобин.
Gly   -   Leu   -   Ser   -   Asp   -   Gly   -                                                                                                                 
 G      L Альфа      S         D         G                                                       
GGG       CUC       AGU       GAU       GGG                                                               
                                                                 
Glu   -   Trp   -   Gln   -   Leu   -   Val   -                                                                     
 E         W         Q         L         V                                                            
GAG       UGG       CAG       CUG       GUG   

Leu   -   Asn   -   Val   -   Trp   -   Gly   -
 L         N         V         W         G  
CUG       AAU       GUC       UGG       GGG
                            
Lys   -   Val   -   Glu   -   Ala   -   Asp   -
 K         V         E         A         D  
AAG       GUG       GAG       GCC       GAC 

Leu   -   Ala   -   Gly   -   His   -   Gly   -
 L         A         G         H         G  
CUU       GCU       GGC       CAU       GGA  

  Gln    -    Glu    -    Val    -    Leu    -    Ile   -
Q Альфа -   L Альфа -    F Кси      K Альфа     I Альфа
  CAG         GAA         GUC         CUC         AUC   

   Gly    -    Leu    -    Phe    -    Lys    -    Thr   -
G Альфа -    L Альфа -    F Кси      K Альфа      T Кси
   GGG         CUG         UUU         AAG         ACU         

  His    -    Pro   -    Glu    -    Thr    -    Leu    -
H Бета     P Альфа     E Альфа     T Альфа     L Альфа -    
  CAC         CCU        GAG         ACC         CUG  

  Asp    -    Lys    -    Phe    -    Asp    -    Lys   - 
D Кси       K Альфа.    F Кси       D Альфа     K Альфа 
  GAU         AAG         UUU         GAC         AAG 

  Phe   -   Lys   -   Asn     -     Leu    -    Lys   -      
F Альфа   K Альфа   N Альфа    L Тета Альфа   K Альфа
  UUC       AAG       AAC           UUG         AAG

  Ser    -    Glu    -    Glu    -    Asp    -    Met   -
S Бета      E Альфа      E Кси       D Кси      M Альфа
  UCA         GAG         GAA         GAU         AUC

  Lys    -    Gly    -    Ser    -    Glu    -    Asp   -
K Альфа     G Альфа     S Бета      E Альфа     D Альфа
  AAG         GGC         UCA         GAG         GAC

  Leu    -    Lys    -    Lys    -    His    -    Gly   -
L Альфа.-   K Альфа     K Альфа     H Альфа      G Кси
  CUG         AAG         AAG         CAU         GGU

  Cys    -    Thr    -    Val    -    Leu    -    Thr   -
C Бета      T Альфа     V Альфа -   L Альфа     T Бета 
  UGC         ACC         GUG         CUC         ACA

  Ala    -    Leu    -    Gly    -    Thr    -    Ile   -
A Альфа     L Альфа -    G Кси      T Альфа     I Альфа
  GCC         CUG         GGU         ACC         AUC

  Leu    -    Lys    -    Lys    -    Lys    -    Gly   -
L Альфа     K Альфа -   K Альфа -   K Альфа -    G Бета
  CUG         AAG         AAG         AAG         GGA

  Gln    -    His    -    Ala    -    Ala    -    Glu   -
Q Кси       H Альфа      A Кси      A Альфа     E Альфа
  CAA         CAU         GCU         GCC         GAG

   Ile    -   Gln    -   Pro    -    Leu    -      Ala   -
I Альфа +    Q Альфа   P Альфа   L Лямбда Бета   A Альфа
   AUC        CAG        CCU         CUA           GCC

  Glh    -    Ser    -    His    -    Ala    -    Thr   -
Q Бета   S Лямбда Бета  H Бета ?    A Альфа     T Бета
  CAA         UCA         CAC         GCC         ACA

  Lys    -    His    -    Lys    -    Ile    -    Pro   -
K Альфа     H Бета      K Альфа      I Кси      P Альфа -
  AAG         CAC         AAG         AUC         CCG

  Val    -   Lys    -   Tyr    -    Leu     -    Glu    -
V Альфа    K Альфа   Y Альфа   L Альфа Лямбда   E Альфа
  GUC        AAG        UAC         CUG          GAG 

Phe    -   Ile     -    Ser    -     Glu    -   Ile   -   
 F Кси      I Кси    S Лямбда Бета    E Кси     I Альфа
UUU         AUC          UCA          GAA        AUU

  Ile    -    Ile*    -    Glu    -    Val    -    Leu   - 
I Кси       I Альфа         E           V           L
  AUC         AUU          GAA         GUC         CUG 

* - 25.06.92
Lys    -    Lys    -    Arg    -    His    -    Ser    -
 K           K       R Лямбда        H       S Лямбда
AAG         AAG         AGA         CAU         UCC

Gly    -    Asp    -    Phe    -    Gly    -    Ala    -
 G           D           F           G           A
GGG         GAC         UUU         GGA         GCA

Asp    -    Ala    -    Gln    -    Gly    -    Ala    -
 D           A           Q           G           A
GAU         GCU         CAG         GGC         GCC

Met    -    Ser    -    Lys    -    Ala    -    Leu    -
 M        S Тета         K           A           L
AUG         AGC         AAG         GCC         CUG

Glu    -    Leu    -    Phe    -    Arg    -    Asn    -
 E           L           F        R Тета         N
GAG         CUC         UUC         CGG         AAU

Asp    -    Ile    -    Ala    -    Ala    -    Lys    -
 D           I           A           A           K
GAC         AUU         GCC         GCC         AAG

Tyr    -    Lys    -    Glu    -    Leu    -    Gly    -
 Y           K           E           L           G
UAC         AAG         GAG         CUA         GGC

Phe    -    Gln    -    Gly    -
 F           Q           G
UUC         CAG         GGC

http://ftp.decsy.ru/nanoworld/index.htm