9920109 Альфа-, бета-структура белка и композиционная таблица генетического кода (науч.)

Генетический код вырожден. Так считалось до настоящего времени. Действительно, каждой из 20 аминокислот может соответствовать несколько (до шести) кодов ДНК. Коды – "синонимы", как будет продемонстрировано ниже, используются для различной ориентации последующего пептида относительно предыдущего. Кроме того, может кодироваться модификация пространственного номера аминокислотного остатка.

Группа атомов, соединенных пептидной связью, (в дальнейшем пептидный сустав – ПС), изображена на рис. 1.

Рис. 1

Кольца, из которых он собран, символизируют валентные электроны атомов, составляющих ПС.

Ориентация последующего пептида относительно предыдущего может соответствовать альфа-структуре, бета-структуре и структуре белка окситоцина (рис. 2).

Рис. 2

Кольца, из которых он собран, символизируют валентные электроны атомов, составляющих ПС.

Это зависит от того, как совместятся точки A, B, C одного аминокислотного остатка с точками D, E, F другого аминокислотного остатка. Таких вариантов три.

В дальнейшем будем называть это альфа, бета и кси ориентацией.

Коды аминокислот, составляющих альфа – спираль белка, по нашей модели не должны совпадать с кодами тех же аминокислот в бета-слое и с кодами этих же аминокислот в петле окситоцина.

http://ftp.decsy.ru/nanoworld/index.htm